专家解析结合RNAi与测序技术研究癌症

　　

生物通报道：随着新一代测序方法的迅猛发展，越来越多的科学家开始利用这一方便快捷的技术进行深层次研究工作，并陆续获得了许多重要的成果。

来自美国国家卫生研究所下属美国国立癌症研究所的Louis M. Staudt教授是一位从事癌症研究多年的科学家，其研究组曾发现了6种能预测淋巴瘤生存期的基因，还弄清楚了骨髓瘤中到底是什么控制骨髓瘤细胞的活性和扩散。这些研究对于癌症的治疗与预防具有重要意义。

之前的研究通过分析人类淋巴瘤免疫球蛋白基因以及基因工程小鼠模型，了解了B细胞抗原受体（BCR）信号在淋巴瘤形成过程中的作用，但是科学家们还没有找到这一受体如何导致人类淋巴瘤形成的遗传与功能性证据。

在这篇文章中，研究人员发现了一种“慢运动”BCR信号，这种信号对于维持弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)ABC亚型中细胞的存活具有重要作用。研究人员认为这种“慢运动”BCR信号是ABC型弥漫大B细胞淋巴瘤的一种新发病机制，因此可以作为治疗这一疾病的一种新策略和靶标。

弥漫大B细胞淋巴瘤是成人非霍奇淋巴瘤中最常见的一种类型，大约占30-40%，多见于中老年人，中国40-50岁居多。在欧美国家，DLBCL 的发病率约占非霍奇金淋巴瘤(NHL)的 31%。中央电视台著名播音员罗京就是因为这一疾病而离世的。

在这一研究工作中，研究人员不仅采用了RNAi干扰技术，还通过Illumina的GAII测序仪进行分析，这两种方法的结合有助于研究工作的顺利进行。

Illumina的GAII测序技术能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测，在分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本，精确地识别可变剪切位点以及cSNP（编码序列单核苷酸多态性），提供全面的转录组信息。并且这一方法相对于传统的芯片杂交平台，RNA测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供更精确的数字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围。

原文摘要：

Chronic active B-cell-receptor signalling in diffuse large B-cell lymphoma

A role for B-cell-receptor (BCR) signalling in lymphomagenesis has been inferred by studying immunoglobulin genes in human lymphomas1, 2 and by engineering mouse models3, but genetic and functional evidence for its oncogenic role in human lymphomas is needed. Here we describe a form of ‘chronic active’ BCR signalling that is required for cell survival in the activated B-cell-like (ABC) subtype of diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL). The signalling adaptor CARD11 is required for constitutive NF-κB pathway activity and survival in ABC DLBCL4. Roughly 10% of ABC DLBCLs have mutant CARD11 isoforms that activate NF-κB5, but the mechanism that engages wild-type CARD11 in other ABC DLBCLs was unknown. An RNA interference genetic screen revealed that a BCR signalling component, Bruton’s tyrosine kinase, is essential for the survival of ABC DLBCLs with wild-type CARD11. In addition, knockdown of proximal BCR subunits (IgM, Ig-κ, CD79A and CD79B) killed ABC DLBCLs with wild-type CARD11 but not other lymphomas. The BCRs in these ABC DLBCLs formed prominent clusters in the plasma membrane with low diffusion, similarly to BCRs in antigen-stimulated normal B cells. Somatic mutations affecting the immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM) signalling modules6 of CD79B and CD79A were detected frequently in ABC DLBCL biopsy samples but rarely in other DLBCLs and never in Burkitt’s lymphoma or mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma. In 18% of ABC DLBCLs, one functionally critical residue of CD79B, the first ITAM tyrosine, was mutated. These mutations increased surface BCR expression and attenuated Lyn kinase, a feedback inhibitor of BCR signalling. These findings establish chronic active BCR signalling as a new pathogenetic mechanism in ABC DLBCL, suggesting several therapeutic strategies.

附：

怎样预防淋巴瘤

预防淋巴瘤首先要养成良好的作息习惯，不要熬夜、学会排解压力、保持愉悦的心情。在饮食上，可常吃葡萄、海带、大豆、番茄、香蕉、橘子、菠菜等碱性食物，以调整体液酸碱平衡，防止酸性废物累积诱发淋巴瘤。

淋巴系统是身体重要的防御系统，它可帮助人体抵抗病毒、细菌等有害物侵袭，常被称为人体的“卫队”。当病菌等有害物入侵时，淋巴组织易脱离人体控制，变成“坏分子”。当“坏分子”越来越多，再加上不良环境等因素作用，淋巴细胞就可能在生长过程中发生变异，形成淋巴瘤。