Nat Genetics见证不同以往的免疫逃逸

　　

生物通报道：来自英国国立医学研究所，美国纽约大学，哈佛大学等处的研究人员发现了一种常见杆菌的不同以往的免疫逃逸（immune evasion）方式，这种令研究人员感到惊讶的方式带给了科学家们新的思路。这一研究成果公布在Nature Genetics杂志上。

领导这一研究的是英国国立医学研究所的Sebastien Gagneux博士，Gagneux博士关注于结核杆菌的研究，曾发文解析了结核杆菌如何产生的耐药性（PLoS Biology，doi ：10.1371/journal.pbio.0060311）。

结核分枝杆菌(M.tuberculosis)，俗称结核杆菌，是引起结核病的病原菌。可侵犯全身各器官，但以肺结核为最多见。结核病至今仍为重要的传染病，估计世界人口中1/3感染结核分枝杆菌。据WHO报道，每年约有800万新病例发生，至少有300万人死于该病。我国建国前死亡率达200-300人/10万，居各种疾病死亡原因之首，建国后人民生活水平提高，卫生状态改善，结核病的发病率和死亡率大为降低。

在对抗结核杆菌等病原菌的斗争中，人类免疫系统起到了关键作用，免疫系统通过识别病原菌的抗原而得以鉴别这些会引发疾病的分子，但是许多病原菌能通过改变它们的抗原而逃脱免疫系统的识别。

在这篇文章中，研究人员利用一种新型高通量DNA测序方法（来自Illumina公司的测序产品），分析了22种来自全球的临床结核杆菌的全基因组，从中他们发现结核杆菌抗原变化的数量和类型要远远低于基因组中其它区域。这主要是因为这些抗原希望能被机体的免疫系统识别——研究人员认为这可能的原因是这些免疫机制会引起典型的肺部损伤和咳嗽，从而有助于这种疾病的传播。

这一发现提出了免疫应答这种细菌的不同靶标，也为研究人员和临床工作人员改变疫苗研究的方向，找到更有效的疫苗提供了新的依据。

（生物通：万纹）

原文摘要：

Human T cell epitopes of Mycobacterium tuberculosis are evolutionarily hyperconserved

Mycobacterium tuberculosis is an obligate human pathogen capable of persisting in individual hosts for decades. We sequenced the genomes of 21 strains representative of the global diversity and six major lineages of the M. tuberculosis complex (MTBC) at 40- to 90-fold coverage using Illumina next-generation DNA sequencing. We constructed a genome-wide phylogeny based on these genome sequences. Comparative analyses of the sequences showed, as expected, that essential genes in MTBC were more evolutionarily conserved than nonessential genes. Notably, however, most of the 491 experimentally confirmed human T cell epitopes showed little sequence variation and had a lower ratio of nonsynonymous to synonymous changes than seen in essential and nonessential genes. We confirmed these findings in an additional data set consisting of 16 antigens in 99 MTBC strains. These findings are consistent with strong purifying selection acting on these epitopes, implying that MTBC might benefit from recognition by human T cells.