Cell杂志最受关注十篇文章（11月）

Cell创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位，近期其倍受关注的文章包括长链非编码RNA，癌症特征等方面的内容……

　　

生物通报道：Cell创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主，许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为：

1. A Long Noncoding RNA Controls Muscle Differentiation by Functioning as a Competing Endogenous RNA
Marcella Cesana, Davide Cacchiarelli, Ivano Legnini, Tiziana Santini, Olga Sthandier, Mauro Chinappi, Anna Tramontano, Irene Bozzoni

在这篇文章中，来自罗马第一大学的研究人员证实一种在成肌细胞分化过程中特异性表达的胞质长链非编码RNA—— linc-MD1可发挥ceRNA活性，通过miR-133 和 miR-135实现对肌肉特异性基因的转录调控因子MAML1 和 MEF2C的表达调控。linc-MD1的表达抑制可导致成肌细胞分化延迟，与杜氏肌营养不良症的发病密切相关。这一研究表明ceRNA网络在肌细胞分化过程中发挥了极其重要的作用。

2. Hallmarks of Cancer: The Next Generation
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg

这是一篇经典的介绍癌症特征的文章，作者是Robert A.Weinberg，这位著名的科学家是美国科学院院士，世界着名的Whitehead研究所创始人之一，他曾发现了第一个人类癌基因Ras和第一个抑癌基因Rb，他的一系列杰出研究工作已经成为肿瘤研究领域乃至整个医学生物学领域的重要里程碑。

从事肿瘤学研究的学者可能都读过他的一篇文章：The Hallmarks of Cancer，这篇综述性文章介绍了肿瘤细胞的六大基本特征，被称为肿瘤学研究的经典论文，到目前为止，这篇论文已经被引用了上万次。

3月新出版的Cell杂志上，Weinberg教授又发表了一篇升级版综述：Hallmarks of Cancer: The Next Generation，这篇同样也是与Douglas Hanahan合作的论文长达29页，简述了最近10年肿瘤学中的热点和进展，包括细胞自噬、肿瘤干细胞、肿瘤微环境等等，并且将原有的肿瘤细胞六大特征扩增到了十个，这十个特征分别是：

自给自足生长信号（Self-Sufficiency in Growth Signals）；抗生长信号的不敏感（Insensitivity to Antigrowth Signals）；抵抗细胞死亡(Resisting Cell Death)；潜力无限的复制能力(Limitless Replicative Potential)；持续的血管生成(Sustained Angiogenesis)；组织浸润和转移(Tissue Invasion and Metastasis)；避免免疫摧毁(Avoiding Immune Destruction)；促进肿瘤的炎症（Tumor Promotion Inflammation）； 细胞能量异常（Deregulating Cellular Energetics）；基因组不稳定和突变（Genome Instability and Mutation）。

3. A DNA Repair Complex Functions as an Oct4/Sox2 Coactivator in Embryonic Stem Cells
Yick W. Fong, Carla Inouye, Teppei Yamaguchi, Claudia Cattoglio, Ivan Grubisic, Robert Tjian

近日来自加州大学伯克利分校的研究人员在新研究中发现了一个Oct4/Sox2共激活因子，并证实其在维持干细胞多潜能性和基因组完整性等方面起关键性的作用。

领导这一研究的是美国著名华裔生物化学家、加州大学伯克利分校生物化学与分子生物学系钱泽南（Robert Tjian）教授，其以研究真核生物细胞遗传信息转录闻名，担任国际顶级生物学期刊《Cell》杂志的编委，1991年当选美国国家科学院院士，2009年担任美国霍华德•休斯医学研究所（HIMI）主席。

在这篇文章中，研究人员利用体外重组转录系统结合生化分析技术鉴别出了一个Oct4/Sox2共激活因子（SCC），并证实SCC可直接与Oct4 /Sox2相互作用从而招募至Oct4和Sox2结合的基因启动子区域。并证实其在维持ES细胞多潜能性和体细胞重编程中发挥关键性的作用。此外，通过进一步的生化特征鉴定，研究人员还证实SCC是一种XPC-RAD23B-CETN2 (XPC) 核苷酸切除修复（nucleotide excision repair;NER）三聚体复合物。研究结果表明这个SCC/XPC具有维持干细胞多潜能性和基因组完整性双重重要功能。

4. Coding-Independent Regulation of the Tumor Suppressor PTEN by Competing Endogenous mRNAs
Yvonne Tay, Lev Kats, Leonardo Salmena, Dror Weiss, Shen Mynn Tan, Ugo Ala, Florian Karreth, Laura Poliseno, Paolo Provero, Ferdinando Di Cunto et al.

在这篇文章中哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心的研究人员以关键肿瘤抑制因子PTEN为研究对象检验了Pandolfi的基因调控假说。研究人员采用实验检测结合计算分析的方法鉴别出了候选的ceRNAs，并证实这些ceRNAs可以miRNA依赖的方式调控细胞内PTEN 和 P-Akt蛋白水平。尤其值得关注的是，研究人员发现在癌症中编码这些PTEN ceRNAs的基因发生了缺失，表明它们具有重要的肿瘤抑制功能。

5. Genome-wide “Re”-Modeling of Nucleosome Positions
Ronen Sadeh, C. David Allis

6. Targeting the SH2-Kinase Interface in Bcr-Abl Inhibits Leukemogenesis
Florian Grebien, Oliver Hantschel, John Wojcik, Ines Kaupe, Boris Kovacic, Arkadiusz M. Wyrzucki, Gerald D. Gish, Sabine Cerny-Reiterer, Akiko Koide, Hartmut Beug et al.

7. Introns within Ribosomal Protein Genes Regulate the Production and Function of Yeast Ribosomes
Julie Parenteau, Mathieu Durand, Geneviève Morin, Jules Gagnon, Jean-François Lucier, Raymund J. Wellinger, Benoit Chabot, Sherif Abou Elela

8. Tumor Metastasis: Molecular Insights and Evolving Paradigms
Scott Valastyan, Robert A. Weinberg

这是由癌症研究领域大牛Robert A.Weinberg与另外一位科学家撰写的综述性文章，介绍了最近肿瘤转移细胞生物学与分子生物学新进展，这些成果将有助于了解与靶向治疗有关的侵袭-转移级联作用。 癌症转移是一个多步骤细胞生物学过程的产物，这个过程被称为侵袭-转移级联作用。侵袭-转移级联作用包括癌细胞传播到解剖学意义上的远距离器官中，以及对新环境的适应过程。这每个事件都由肿瘤细胞遗传学，或者（和）表观遗传的改变，以及非肿瘤基质细胞共同作用驱使——非肿瘤基质细胞可以帮助初始转移细胞获得“安居乐业”的通行证。

在今年的美国癌症研究学会（AACR）年会上，加州大学圣地亚哥分校的病理学家David Tarin在数百名同行面前针对肿瘤学研究中的一项重要的癌症转移假说提出了质疑，他认为数十年来针对这一假说开展的研究有可能将科学家们导入了歧途。  

人类的大部分癌症主要累及的是器官的上皮细胞层。在通常情况下上皮细胞并不具有活动能力。而在胚胎发育过程中，由于移动相关的蛋白质表达增高，连接细胞的蛋白质分泌受到抑制，促使某些上皮细胞开始向具有活动能力的间质细胞转化，实现细胞在胚胎中的迁移。基于此，科学家们提出在癌症中或许也存在相同的上皮-间质转化（EMT），并有可能是癌细胞与周围细胞分离，通过血液循环播种形成新肿瘤病灶的基础。

目前EMT已成为癌症研究的一个热点课题，并且有越来越多的数据表明EMT在癌症转移中发挥了重要的作用。


9. In Vivo Identification of Tumor- Suppressive PTEN ceRNAs in an Oncogenic BRAF-Induced Mouse Model of Melanoma
Florian A. Karreth, Yvonne Tay, Daniele Perna, Ugo Ala, Shen Mynn Tan, Alistair G. Rust, Gina DeNicola, Kaitlyn A. Webster, Dror Weiss, Pedro A. Perez-Mancera et al.

在这篇文章中，来自哈佛医学院的研究人员利用一种“睡美人”转座子插入诱变的黑色素模型小鼠筛查出了几个假定PTEN ceRNAs，并对这些假定PTEN ceRNAs进行了功能验证。研究人员发现其中的PTEN ceRNA ZEB2以一种miRNA依赖的方式调控了PTEN蛋白水平。PTEN ceRNA ZEB2缺失可导致PI3K/AKT信号激活，促使细胞发生转化，诱导肿瘤发生。

10. Exogenous Stimuli Maintain Intraepithelial Lymphocytes via Aryl Hydrocarbon Receptor Activation
Ying Li, Silvia Innocentin, David R. Withers, Natalie A. Roberts, Alec R. Gallagher, Elena F. Grigorieva, Christoph Wilhelm, Marc Veldhoen

（生物通：万纹）