Sanger microRNA数据库(miRBase)升级至18.0版

2011年11月4日（北京时间），Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至18.0版。在新版本中，发夹前体序列升至18226条，新增1488条；成熟miR和miR*产物共21643条，新增1929条；新版本报道序列共涵盖个168个物种。

从之前的版本（17.0）开始，miRBase一直致力于对成熟序列进行重命名，用-5p/-3p命名法取代miR/miR*命名法。本次更新过程中大约对将近1400条成熟序列进行了重命名，涵盖人、小鼠和线虫3个物种。（关于miRNA命名规则请浏览http://www.mirbase.org/blog/2011/04/whats-in-a-name/）

斑马鱼互补miRNA（miRNA complement）发生了很大的变化，依据Zv9基因组拼装对收录序列进行了合理的调整，删除了26条斑马鱼序列，并新增了12条代表重复基因位点的序列。

新增miRNA序列动物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增103条，Mus musculus [小鼠]新增21条，Oryzias latipes [青鳉]新增152条。植物物种中增长最为显著的是Medicago truncatula [蒺藜苜蓿]新增260条，Glycine max [大豆]新增159条，Oryza sativa [水稻]新增90条，Arabidopsis thaliana [拟南芥]新增59条。

此外 ，新版本中首次收录的物种共有15个，包括：

 囊泡藻界：Phaeodactylum tricornutum [三角褐指藻] (13)
 7个动物物种： Anolis carolinensis [绿安禄蜥] (282)， Macropus eugenii [尤金袋鼠] (2)，Sarcophilus harrisii [袋獾] (67)，Rhipicephalus microplus [微小扇头蜱] (24)，Ascaris suum [猪蛔虫] (97)，Glottidia pyramidata (1)，Terebratulina retusa (1)。
 6个植物物种：Cucumis melo [甜瓜](3)，Acacia auriculiformis [大叶相思] (7)，Acacia mangium [马占相思] (3)，Salvia sclarea [熏衣苏草] (18)，Bruguiera cylindrica [柱果木榄] (4)，Bruguiera gymnorhiza [木榄] (4)。
 病毒：Herpesvirus saimiri strain A11 (3)。

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关于miRBase
miRBase序列数据库是一个提供包括miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库，是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务，允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息，详情请访问http://www.mirbase.org/。

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