人物:他是如何一步步解决难题的

【字体: 时间:2011年12月05日 来源:生物通

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  同期Nature Methods报道Bamberg研究组的一项最新成果:看似简单的融合方法解决了光遗传学研究的一大问题。之前的研究表明channelrhodopsin-2受到蓝光的刺激时……

  

生物通报道:《Nature Methods》本月介绍了一位来自德国马普研究院的科学家:Ernst Bamberg,十年前,这位科学家与另外两位电生理研究领域的著名学者Georg Nagel和Peter Hegemann,共同开始了探索引导绿藻向光性的蛋白的道路,这种蛋白与之前所知的光感蛋白不同,比如光活化细菌离子泵,这种藻类视紫质(algal rhodopsins)蛋白属于光控离子通道,反应更快。

上文链接:Nat Methods人物:光控蛋白研究领衔者

除此之外,此次同期Nature Methods还报道Bamberg研究组的一项最新成果:看似简单的融合方法解决了光遗传学研究的一大问题。之前的研究表明channelrhodopsin-2受到蓝光的刺激时,会导致阳离子通过细胞膜,细胞去极化,神经元激活,而盐菌紫质(halorhodopsin)在受到橙色光的刺激时,则会引发氯离子通过细胞膜,细胞极化,阻止细胞激活。

如果能很好的利用这一现象,就能更好的通过光遗传学分析生物现象,但是要实现这个方法,却不容易,因为当细胞表达两种光遗传学蛋白的时候,它们表达两种蛋白的表达水平不均衡,一种可能很多,而另一种可能很少。而且不同细胞的表达比率也不一致。

为了解决这个问题,Bamberg研究组想到了一个看似简单的方法:他们利用一种蛋白工程方法,研发了一种融合蛋白,这种蛋白中两个光遗传学工具物理上相连,这样这两个蛋白不仅会一起表达了,而且还会同时出现在细胞膜上。 下篇:

具体的细节当然更复杂——如果这两种蛋白直接物理上连接,那么其中一种就会关闭另外一种,因此研究人员在其中添加了一个螺旋helix,为了能连接这两种蛋白,他们选择的是大鼠一种ATP酶中的一部分,和一个荧光蛋白的一部分。

最初这看起来十分不错,这一融合体似乎能出现在细胞膜上了,“我们看到了一些成果,感到十分高兴”,Bamberg表示,“然后我们开始分析这些数据,结果我们发现这个融合体无法正常工作”,挫折并不意外,Bamberg说,“科学就是这样,你不能定下一个(完整的)计划,说这一定能行。”

Bamberg研究组继续进行了改造:改变连接体长度,开启每一种视紫红质所在那一边的连接体,最终,在尝试了约20个融合体后,他们获得了可靠的结果,这对蛋白能精确的调控培养神经细胞中的膜电位。

就像是作为嘉奖,这个连接体被发现能作用于几种光遗传学工具中,除了连接channelrhodopsin-2和halorhodopsin外,研究人员还将蓝光作为吸收光源的channelrhodopsin-2,与黄光作为吸收光源的channelrhodopsin-1连接了起来,可以用于在可见光广谱范围内激活神经细胞。“现在我们有了能将各种视紫质连接在一起的‘磁带’了”,Bamberg说。

这项成果无疑是重要的,因为利用这种方法,光遗传学工具能帮助科学家们精确激活或者移植某种特殊的神经元,从而在大脑神经功能研究,行为研究中大放异彩。目前研究人员还打算在模式动物中进行进一步的分析实验。

作为2010年最受关注的技术成果,光遗传学工具不仅能用于神经研究领域,比如激活清醒哺乳动物的单一神经元,直接演示神经元激活表现出的行为结果,而且还能拓展到细胞生物学或者细胞发育等研究领域,这一技术开辟了一个新的令人激动的研究领域,科学家们可以挑选出一种类型的细胞然后发现其功能。

(生物通:张迪)

原文摘要:

The author file: Ernst Bamberg

Ernst Bamberg has grown used to surprises from microbial rhodopsins. About a decade ago, he, together with Georg Nagel and Peter Hegemann, characterized the proteins that help green algae move toward light. Unlike previously known light-sensing proteins, such as light-activated bacterial ion pumps, algal rhodopsins are light-gated ion channels that operate on a much faster time scale.

A gene-fusion strategy for stoichiometric and co-localized expression of light-gated membrane proteins
The precise co-localization and stoichiometric expression of two different light-gated membrane proteins can vastly improve the physiological usefulness of optogenetics for the modulation of cell excitability with light. Here we present a gene-fusion strategy for the stable 1:1 expression of any two microbial rhodopsins in a single polypeptide chain. By joining the excitatory channelrhodopsin-2 with the inhibitory ion pumps halorhodopsin or bacteriorhodopsin, we demonstrate light-regulated quantitative bi-directional control of the membrane potential in HEK293 cells and neurons in vitro. We also present synergistic rhodopsin combinations of channelrhodopsin-2 with Volvox carteri channelrhodopsin-1 or slow channelrhodopsin-2 mutants, to achieve enhanced spectral or kinetic properties, respectively. Finally, we demonstrate the utility of our fusion strategy to determine ion-turnovers of as yet uncharacterized rhodopsins, exemplified for archaerhodopsin and CatCh, or to correct pump cycles, exemplified for halorhodopsin.

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