2010创新产品:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析试剂盒[新品推荐]

【字体: 时间:2011年03月24日 来源:生物通

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  继2008年、2009年成功评选出“生命科学十大创新产品”之后,生物通于2010年11月第三度推出“生命科学十大创新产品”评选活动。在这次活动中,我们共收到50个候选产品。经过三个月的读者投票和专家评鉴,2010生命科学十大创新产品终于出炉……

继2008年、2009年成功评选出“生命科学十大创新产品”之后,生物通于2010年11月第三度推出“生命科学十大创新产品”评选活动。在这次活动中,我们共收到50个候选产品。经过三个月的读者投票和专家评鉴,2010生命科学十大创新产品终于出炉……

众所周知,5-甲基胞嘧啶(5-mC)是哺乳动物基因组DNA中主要的表观遗传学标志。除此之外,研究人员最近还发现了一种新的表观遗传学修饰——5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)。它在表观遗传学上的功能可能与5-mC不同。尽管到现在为止还不确知其功能,有研究人员猜测它在调控基因的表达与关闭过程中起着重要的作用。现有技术能够鉴定出基因组DNA中的5-mC,但是却无法区分5-mC和5-hmC。

为此,New England Biolabs(以下简称NEB)推出了EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析试剂盒。此试剂盒是市场上第一个定量5-hmC的PCR型分析,且操作简便,只需三步。它利用T4 β-葡萄糖基转移酶(T4-BGT)在5-hmC的羟基上添加葡萄糖,从而区分5-mC和5-hmC。当5-hmC出现在CCGG的背景下,这种修饰将一个可切割的MspI位点转化成不可切割的。此外,这种方法还能与现有的分析技术兼容,从而扩展到高通量。

这种创新的工具简化了表观遗传学研究,能帮助我们了解5-hmC在表观基因组中的作用,对疾病相关生物标志物的开发很关键。因此,它也被评为“2010生命科学十大创新产品”。为此,生物通就一些读者感兴趣的问题,采访了NEB公司市场部的余先生。

生物通:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析试剂盒的独特之处在哪里?

NEB:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析试剂盒能够在特定的基因位点上识别并定量5-hmC和5-mC,是第一个研究、区分5-hmC和5-mC的试剂盒。这个三步法试剂盒将会对您研究表观遗传学、DNA甲基化,特别是研究5-hmC有所帮助。

生物通:除了此试剂盒,NEB公司还提供了哪些表观遗传学研究试剂?

NEB:NEB 公司提供一系列甲基化依赖性以及对甲基化呈现不同敏感性的限制性内切酶,这类内切酶可以将 DNA 切割成适当片段,有利于甲基化的分析与研究。MspJI 系列内切酶是属于依赖甲基化和羟基甲基化而发挥作用的内切酶,可以将 DNA 切割成以 5-hmC (5-羟甲基胞嘧啶) 和 5-mC (5-甲基胞嘧啶) 为中心的 32 个碱基片段,通过对这些片段的分离、测序,就能绘制出表观遗传学特定修饰位点图谱。

NEB 公司还提供多种 DNA 甲基转移酶,用于基因表达研究,可以针对 DNA 特定位点进行甲基化修饰。特别是 CpG 甲基转移酶尤其适用于研究 CpG 甲基化对基因表达及功能的影响。

除上所述,NEB 公司还提供各种甲基化和非甲基化修饰的基因组 DNA,可以作为各种表观遗传学研究的对照样品。

在组蛋白研究方面,NEB 公司还提供各种类型的组蛋白,这些组蛋白均为没有任何翻译后修饰的高纯度重组蛋白质,可作为对照底物,研究修饰组蛋白的酶类;同时这些组蛋白还可以聚成八聚体,研究哪些结合后才能发挥作用的组蛋白或 DNA。

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