2010创新产品:LabChip XT核酸片段回收仪[新品推荐]

【字体: 时间:2011年03月30日 来源:生物通

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  继2008年、2009年成功评选出“生命科学十大创新产品”之后,生物通于2010年11月第三度推出“生命科学十大创新产品”评选活动。在这次活动中,我们共收到50个候选产品。经过三个月的读者投票和专家评鉴,2010生命科学十大创新产品终于出炉……

继2008年、2009年成功评选出“生命科学十大创新产品”之后,生物通于2010年11月第三度推出“生命科学十大创新产品”评选活动。在这次活动中,我们共收到50个候选产品。经过三个月的读者投票和专家评鉴,2010生命科学十大创新产品终于出炉……

新一代测序的速度越来越快,费用也在不断降低,但整个流程中还有不少瓶颈,限制了它的通量。最耗时的任务之一就是在文库制备过程中对打断的基因组DNA进行基于凝胶的大小筛选。除了耗劳力和不易扩展之外,这种手工的方法还会引入不同运行之间、不同操作员之间的差异。此外,手工操作也不是很准确,通常会有10%的误差。

为了消除这个关键的瓶颈,提高新一代测序技术的文库制备效率,Caliper LifeSciences公司推出了LapChip XT,一种自动化的核酸回收仪器

基于前沿的Lab-on-chip技术,LabChip XT利用多通道的一次性芯片,能在30分钟内自动完成多达4个样品(PCR产物、smear均可)的电泳-目标片段分离-回收,液相产物可直接用于下游步骤。这种独特的设计排除了交叉污染的可能性,为分析和定量提供了数字数据。欢迎索取详细资料和报价

对于新一代测序用户而言,LabChip XT的出现可谓福音,不仅得率高,准确可重复,且无污染之忧,适合各种测序平台。因此,它也被广大读者和专家评为“2010生命科学十大创新产品”。为了让读者更好地了解此产品以及Lab-on-Chip平台,生物通采访了Caliper LifeSciences的中国代理商——基因有限公司市场部的胡欣女士。

生物通:请问LabChip XT核酸片段回收仪是如何在这么短的时间内完成电泳-分离-回收这个过程?

胡女士:下面是LabChip XT微流控的示意图、通常我们先在样品孔(S)及废物孔(W)间加上电压,在电场作用下,核酸样品从左向右迁移分离,通过switch point后进入废物孔;而当我们指定大小区间内的样品来到switch point时,XT会将正极从废物孔切换到收集孔(C),从而使得指定的样品被驱策进入收集孔。

之所以XT能够在15-30分钟的时间内就完成整个电泳-分离-回收的过程,主要得益于微流控技术“微型化”的特点,使得我们可以在不长的channel上加相对高的电压,使得整个过程在很短的时间内即可完成,同时还能够保证分辨率与准确性。

而channel独立分隔并内置电极的设计,使得用户完全没有交叉污染之虑,也保证每个channel可以独立使用并进行不同要求的产物回收。

生物通:目前是否有国内的用户在使用这一仪器?他们的反馈如何?

胡女士:LabChip XT是我们于2010年底推出的最新产品,国际上很多知名测序中心,包括Broad Institute、华盛顿大学、Sanger中心等,及二代测序产品的供应商如Illumina等均参与了其β测试,短短时间内已有近百位新一代测序用户接受了XT。目前我们国内很多测序中心也已表示了明确的兴趣并正在对其进行测试,已完成的测试数据是令人满意的,相信LabChip XT很快就会为国内众多测序中心提供优质服务!

生物通:Caliper LifeSciences还为新一代测序推出了哪些系统?

胡女士:除了LabChip XT,我司还为新一代测序用户,尤其是有较多的Exome Sequencing、Targeted Sequencing、Transcriptome Sequencing以及RNAseq、Chipseq的用户,专门设计并推出了自动化样品制备平台——NGS workstations,以解决上述应用中的瓶颈——文库制备。

迈阿密大学基因组研究中心的实际使用表明,使用我们的自动化样品制备平台,配合LabChip XT等,能够将全外显子捕获及相应测序文库构建的效率,在确保最终测序数据质量的前提下,从原本人工操作时的12 sample/周/人提升至200 sample/周/人以上。

作为一个开放式系统,该自动化样品制备平台支持目前各种主流NGS chemistry,并预置有经过优化与实际测评的相关method,避免了用户自行优化自动化method的时间、人力以及实际浪费、平台同时为将来可能的chemistry、技术(如三代测序)及通量扩展预留了充足的硬件空间。本着服务用户的精神,我司还将不断推出配合新的NGS chemistry的自动化method,使其成为一个真正人性化的自动化产品。

此外,当您的通量提高时,我们的另一款微流控芯片产品——LabChip GX将能够为您的样品QC环节提供与现行的标准——Agilent Bioanalyzer同样的高质量数据,但通量更高、速度更快、试剂耗材人力消耗则更低。

生物通:目前Lab-on-chip平台有哪些进展和趋势

胡女士:通过多年的研发及基于市场反馈的产品优化改进,目前Caliper旗下共有三款商品化的Lab-on-Chip产品——用于片段分离回收的LabChip XT,用于核酸及蛋白样品分析检测及质控的LabChip GX/GXII,以及用于针对酶类靶标小分子药筛的EZ Reader。即将推出的,还有用于临床分子检测的LabChip DX。

我们的Lab-on-Chip专利技术也正为安捷伦、伯乐等公司的一些产品所采用。而Lab-on-Chip技术本身近年来也有了相当长足的发展,Roche的新一代测序平台中亦有采用微流控技术,也有一些厂家将微流控技术应用于实时荧光定量PCR的assay setup以达成超高通量,微量消耗等目的。

除了商品化的产品,在研的Lab-on-Chip项目更是百花齐放,应用范围涵盖从基础科研到药物研发乃至临床应用。相信在不久的将来,LabCHip相关产品必将能够成为生命可选研发及个性医疗的重要工具,最终创造生命的美好未来。

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