基因组研究为攻克香港猩红热疫情提供线索

【字体: 时间:2011年06月28日 来源:华大基因

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  6月24日,香港大学、深圳华大基因研究院和军事医学科学院微生物流行病研究所今日发布对香港猩红热致病菌株的最新研究进展,发现一种重要的毒力因子及多种抗生素的抗性基因。

  

6月24日,香港大学、深圳华大基因研究院和军事医学科学院微生物流行病研究所今日发布对香港猩红热致病菌株的最新研究进展,发现一种重要的毒力因子及多种抗生素的抗性基因。

该研究小组昨天发布的结果表明该菌株属于链球菌M12血清型。进一步的分析发现此次香港流行的菌株与该血清型的其他菌株相比,获得了一个编码超抗原(superantigen)的毒力基因,该基因以前只在引起重症感染和高致死率的M3型化脓链球菌中发现过,研究人员推断该基因可能是通过噬菌体被转移到香港爆发菌株中(类似此次德国爆发的大肠杆菌获得强毒性的机制)。超抗原可以与人体免疫系统相互作用,激活大量T细胞(免疫细胞)并产生应对机制,可能引起机体发热、休克甚至死亡。因此,该血清型菌株获得外源毒力因子可能是这次猩红热广泛流行,且出现重症及死亡患者的原因之一。

研究人员调查还发现,该菌株携带了一些抗药性基因,其中包括对四环素类、大环内酯类及喹若酮类抗生素的抗性基因。这些抗药性基因的存在可能会对抗生素治疗造成一定困难。

该研究小组还将继续对该病菌的遗传图谱进行分析,并结合流行病学的研究,找出此次病情的爆发原因和病菌的进化变异机制。

华大基因已公布了该菌株最新的基因组图谱 (ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/S.pyogenes/S.pyogenes_005-D5/S.pyogenes_005-D5.20110624.contig.fa.gz

ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/S.pyogenes/S.pyogenes_005-D6/S.pyogenes_005-D6.20110624.contig.fa.gz),并将继续更新图谱信息。

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