测序竞赛升级 两款新品同日推出[选购宝典]

测序市场的领头羊Illumina公司将推出一款新的测序仪。这个名为HiSeq 2500的系统将让研究人员和临床医生能够在大约24小时内完成整个基因组的测序，即“一天一个基因组”。而在几小时之前，Illumina的老对手，Life Technologis公司也宣布推出了Ion Proton测序仪，旨在一天内完成人类基因组的测序，耗资约为1000美元。

测序市场的领头羊Illumina公司将推出一款新的测序仪。这个名为HiSeq 2500的系统将让研究人员和临床医生能够在大约24小时内完成整个基因组的测序，即“一天一个基因组”。过去，获得结果的时间还不够快，可谓进入临床的瓶颈，另外一个瓶颈是数据分析。对于研究人员来说能同一天分析数据是测序仪进入临床的关键因素之一。新测序仪能在24小时内完成整个基因组的测序，正好解决了这个问题。

这个消息是由Illumina公司的首席执行官Jay Flatley在摩根大通保健大会上宣布的，而在几小时之前，Illumina的老对手，Life Technologis公司也宣布推出了Ion Proton测序仪，旨在一天内完成人类基因组的测序，耗资约为1000美元。（详细报道：http://www.ebiotrade.com/newsf/2012-1/2012111113421355.htm）

自此，两大测序巨头的测序竞赛再次升级。此前三家测序巨头的竞争，使得测序仪读取DNA数据的速度越来越快，速度提升之快已经超越了著名的“摩尔法则”对微处理器加速的预测。第一回合中，Illumina推出的Genome Analyzer，迅速占领了新一代测序的市场，先拨头筹。相比之下ABI推出的SOLiD虽然性能强大，可惜在单机高达50万美元起步的高端测序仪市场，还是稍晚了一步。ABI的转机出现在2010年，不过当时已不再是ABI，而是合并之后的Life Technologies。这年初，Ion Torrent公司一鸣惊人，推出了一款廉价小巧的半导体测序仪。Ion Torrent的创始人是Jonathan M. Rothberg，这个测序领域的传奇人物在2000-2007年间创立的454 公司推出了第一台新一代测序仪，被罗氏收购。2007年-2010年他成立Ion Torrent公司，几个月后，这家公司被Life Tech收购，Rothberg 成为Life Tech公司半导体测序部门的领头人。Ion PGM虽不是第一个上市的个人型测序仪，但因价格低廉、表现出色，获得了很好的市场反应，相比50万美元以上级别的超豪华设备，5-10万美元级别的Ion PGM更容易为普通实验室接受，无怪迅速成为当年卖的最快的测序仪。Illumina随即推出价格在10万美元级别的个人型测序仪MiSeq。

测序规模稍小而价格低廉的个人型测序仪的出现，使得新一代测序技术不再是大型实验室的专享，对于普通规模的实验室来说，这种新技术不再遥不可及。随着新技术在更多实验室的逐渐普及和应用，又进一步深刻地推进了研究方法的变革，随之加速了我们对生命本质的探索。一些过去想都无法想象的研究方法，如今已触手可及--两大巨头在小型测序仪市场上的竞争再次打响，可谓功不可没。
 
回到正题，这次推出的两款测序仪，同样是一天一个基因组，主要差别有哪些呢？据Illumina公司的Flatley介绍，HiSeq 2500的价格将是74万美元（美国报价，不适合中国），也可从现有的HiSeq 2000升级，费用是5万美元。仪器采用两种模式，既可在27小时内产生120 Gb，也可在标准的HiSeq运行中产生600 Gb。HiSeq 2500显然将延续和扩大Illumina在高端测序仪领域的领先优势。索取资料>>

Life Tech的新仪器Ion Proton只需要15万美元（2012年1月Life Tech网站新闻公布, 美国本土报价，不适合中国。有网友补充，15万美金是主机不带附属设备的，全部买齐大概要40万美金。）。虽然目前Life Tech还没有提供详细的数据，看来Ion Proton在主攻的个人型测序仪市场上将再度掀起热潮，因为在美国NIH可能削减经费的形势下，Ion Proton的价格可能会吸引相当一部分科学家。目前Ion PGM的通量从314芯片的几十Mb到316芯片的几百Mb，以及新上市的Ion 318芯片超过1GB。索取Ion Proton测序仪的详细资料

Chad Nusbaum是Broad研究院基因组测序和分析项目的联合主管，他也是Ion Proton系统的早期用户。他预期Ion Proton系统的价格将是主要卖点。他觉得或许（两者）数据质量会有点差别，但不会太多。Ion Proton系统的低价格会吸引不少粉丝。对于Illumina的新仪器，他认为，速度快当然很好，但成本也是个考虑因素。（以上信息来自福布斯）不过毫无疑问，在高端测序仪市场已经占尽先机的Illumina并不会轻易放弃平价测序仪市场，我们期待不久的将来，Illumina还会再宣布Miseq的升级。早买仪器能早出结果早发文章，晚点买呢，或许能买到更先进的版本，但又怕等决定买时人家已经发表文章了，公布距离真正发售还有点时间，大家还Hold不Hold得住呢？

一天一个基因组，听上去很美，但也对数据分析提出了更高的挑战。一天一个，分析得过来么？费用如何？之前有专家预测，尽管千元基因组目标的实现指日可待，但对于测序后的数据分析，则可能还要再加两个零。测序仪的不断升级也意味着，另一个数据分析市场的大门敞开了。学生物的将来不学生物信息学恐怕不行了！

耗时十年的人类基因组计划暂且不提。2007年，当时的454生命科学公司对诺奖得主James Watson进行了基因组测序，费用不到100万美元。短短五年的时间，个人基因组测序费用已降低了1000倍。测序技术发展之快，令人惊叹。有网友打趣，也许再过十年去面试的时候，电子简历后面还要附上自己的全基因组序列。

当然，我们也要感谢这些测序公司。它们的良性竞争催生了性能更强、价格更低的新仪器，测序技术已经在深刻地推动着科研领域的变革，也将推动个性化医疗的发展。在过去一年，已有一些病患受益于新一代测序技术。未来，也许我们每一个人都能受益。（生物通 薄荷）