Cell盘点2011年五大综述文章

在新年第一期Cell杂志上，公布了各种盘点文章，其中值得关注的Cell五大综述文章，囊括了癌症研究，干细胞研究，ceRNA新假说等多方面内容，不容错过。

　　

生物通报道：Cell创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主，许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。在新年最新一期的Cell杂志上，公布了各种盘点文章，其中值得关注的Cell五大综述文章，囊括了癌症研究，干细胞研究，ceRNA新假说等多方面内容，不容错过。

第一篇：Hallmarks of Cancer: The Next Generation.

这篇文章从每月刊登的Cell下载量和关注度最高的论文来看，肯定是要上榜的，这篇由癌症研究泰斗：Robert A.Weinberg完成的最新癌症综述是之前他的一篇文章“The Hallmarks of Cancer”的升级版——之前那篇文章介绍了肿瘤细胞的六大基本特征，被称为肿瘤学研究的经典论文，到目前为止，这篇论文已经被引用了上万次。

2011年3月，Robert A.Weinberg同样是和Douglas Hanahan合作，完成长达29页的论文，简述了最近10年肿瘤学中的热点和进展，包括细胞自噬、肿瘤干细胞、肿瘤微环境等等，并且将原有的肿瘤细胞六大特征扩增到了十个，这十个特征分别是：

自给自足生长信号（Self-Sufficiency in Growth Signals）；抗生长信号的不敏感（Insensitivity to Antigrowth Signals）；抵抗细胞死亡(Resisting Cell Death)；潜力无限的复制能力(Limitless Replicative Potential)；持续的血管生成(Sustained Angiogenesis)；组织浸润和转移(Tissue Invasion and Metastasis)；避免免疫摧毁(Avoiding Immune Destruction)；促进肿瘤的炎症（Tumor Promotion Inflammation）； 细胞能量异常（Deregulating Cellular Energetics）；基因组不稳定和突变（Genome Instability and Mutation）。

每年由于癌症去世的人群不断增长，每年投入到癌症研究中的经费也在不断增加，近年来由于一些技术的发展，比如RNAi，和测序新技术，癌症研究焕发出了新的活力，比如科学家不断的在发现新的癌基因，也不断的找到了许多新的治疗途径。

第二篇：A ceRNA Hypothesis: The Rosetta Stone of a Hidden RNA Language?

来自哈佛大学医学院的著名癌症遗传学家Pier Paolo Pandolfi早在1994年开始了肿瘤生物学和遗传学方向的研究生涯，他的研究组曾成功利用小鼠为模型研究并揭示了多种肿瘤发病的分子机理和遗传学机制，包括白血病、淋巴瘤以及前列腺癌等实体肿瘤。

2011年9月，Pandolfi等人提出了一种关于信使RNAs如何转录假基因，以及长链非编码RNAs如何相互“交流”的新假说，这些进一步的研究将有助于癌症等疾病的分子机理的解析。

这一假说即：ceRNA（competing endogenous RNA，竞争性内源RNA）假说，认为这种ceRNA活性能形成一种大规模转录调控网络，可以扩大人类基因组中的功能性遗传信息。他们认为这种活性通过miRNAs应答元件，可以作为mRNAs转录假基因，以及长链非编码RNAs相互“交流”的新语言。Pandolfi等人也认为ceRNA活性也在病理条件，比如癌症中扮演了重要角色，因此对于解开一些癌症研究之谜具有重要意义。

在一个月后，来自哈佛医学院，哥伦比亚大学和罗马第一大学的三个研究小组又从多个方面对Pandolfi的基因调控假说进行了验证，其中包括哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心的研究人员以关键肿瘤抑制因子PTEN为研究对象检验了Pandolfi的基因调控假说。研究人员采用实验检测结合计算分析的方法鉴别出了候选的ceRNAs，并证实这些ceRNAs可以miRNA依赖的方式调控细胞内PTEN 和 P-Akt蛋白水平。尤其值得关注的是，研究人员发现在癌症中编码这些PTEN ceRNAs的基因发生了缺失，表明它们具有重要的肿瘤抑制功能。

其次还有格伦比亚大学的研究人员基于基因表达数据及配对的miRNA图谱绘制出了恶性胶质瘤细胞中由超过248,000种miRNA介导的大型RNA互作网络。以及哈佛医学院的研究人员利用一种“睡美人”转座子插入诱变的黑色素模型小鼠筛查出了几个假定PTEN ceRNAs，并对这些假定PTEN ceRNAs进行了功能验证等。

第三篇：Principles and Strategies for Developing Network Models in Cancer.

来自哥伦比亚大学的Dana Pe'er和Nir Hacohen在这篇综述中，针对目前基因组数据分析的盛行，介绍了癌症研究网络模型的策略和方法。

目前高通量测序技术，全基因组数据分析的蓬勃发展，给分析，操控，重构细胞功能性分子网络带来了契机。这篇文章指出了构建基因组数据分子网络模型的三大准则和六条策略。并且以癌症研究作为范例，描述了构建能识别疾病表型基因和过程的网络模型，具体的实验和计算方法。文章结尾，这两位作者还探讨了通过对癌症整体网络水平的分析，如何能预测药物应答和治疗导向。

第四篇：Control of the Embryonic Stem Cell State.

文章作者Richard Young博士是美国麻省理工学院whitehead研究所教授，世界知名的基因组研究专家，他同时是《科学》杂志，美国国家健康研究院，世界卫生组织的顾问。

在这篇干细胞重要综述中，作者指出，胚胎干细胞与多能诱导性干细胞在再生医学上具有极大的潜力，这些细胞能在培养基中保持无分化状态增殖，并被诱导分化成各种类型的特异性细胞。而且这些细胞能为研究细胞识别，以及哺乳动物早期发育提供强有力的模式系统。

近期的研究为深入了解胚胎干细胞状态的转录调控提出了新观点，比如多能性中的调控循环，这些研究将有助于揭示哺乳动物基因表达，染色体结构与基因表达之间的关联，以及人类疾病中存在的基础性机理。

第五篇：Impulse Control: Temporal Dynamics in Gene Transcription.

研究不断发现，基因表达调控环路与环境刺激，不同因素以及疾病密切相关。来自哈佛麻省Broad研究院的女科学家Aviv Regev（据称是犹太美女科学家）完成的这篇综述主要概括了目前对于真核生物和原核生物中，基因表达时空动力学研究，以及其中的分子机制的了解情况。

作者总结了典型的几种时空模型，比如应答短暂环境刺激的impulse、single-pulse模型，应答发育因素的sustained /state-transitioning模型，以及振荡模型。

（生物通：张迪）