罗氏454测序用于野生双峰驼基因组图谱绘制[创新技巧]

中国及中亚细亚温带荒漠地区的骆驼均为双峰骆驼(Bactrian camel)，中国的双峰驼集中分布于内蒙古西部、宁夏、新疆、甘肃的温带荒漠和荒漠草原区，占全国总驼数的95%。且中国尚有数量比大熊猫还少的世界珍稀濒危动物—野生双峰驼存在。内蒙古阿拉善盟是中国骆驼最多的地区，拥有双峰驼10万峰以上，约占全国骆驼总数的33%、世界骆驼总数的25%，素有“驼乡”之称。这里出产的阿拉善双峰驼以其体型大、绒质好等特点被确定为国家优良畜种，它具有耐粗饲、耐饥渴、耐高温、耐严寒、耐负重、抗干旱、抗风沙、抗疾病等特殊能力。

最近国内大学研究者们携手国内生物信息学专家们在Nature Communication上发表文章1，报道完成了野生双峰驼2.01Gb的基因组草图，并揭示了野生双峰驼能在极其严酷的环境下生存的秘密。利用454 GS FLX测序系统及短平台进行了混合拼接，得到了120,352条scaffold，其中13,544条scaffold超过1kb，3,453条scaffold超过10kb，大于1kb的scaffold N50达到了2Mb。预测编码基因20821个，平均含8个外显子，平均编码区长1322bp，编码区GC含量达52%，显著高于全基因组GC含量41%。

通过对编码基因的考察，研究人员们发现双峰驼的代谢通路调节方面的基因快速进化，因此在食物消化后的吸收与常规反刍动物完全不同。另外，双峰驼可承受大量血糖也与部分基因改变有关，而这些基因正是与人类II型糖尿病相关的基因。对这些基因进一步的研究可能帮忙解开人体中胰岛素调节以及糖尿病发生机制。在人体中中CYP2J基因控制高血压，然而双峰驼体内含有多个该基因的拷贝，使其即使在吃了大量盐的情况下仍能保持较低的血压。

1. Jirimutu. et al. Genome sequences of wild and domestic bactrian camels. Nat. Commun. 3:1202 doi: 10.1038/ncomms2192 (2012).

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