个人基因组测序之初体验

生物通报道 近日，彭博社记者John Lauerman与大家分享了他的个人基因组测序故事。他认为个人基因组测序既经济，又可怕。

大约4个月前，他走进一个哈佛研究机构的实验室，挽起衣袖，让研究人员抽出一管血，开展基因组测序。如今，他的基因组已经破译完成。

他认为，值得庆幸的是，他没有在报告中看到“阿尔茨海默氏症”的字样，尽管他的家族成员中有人患老年痴呆。他的报告中提到了一个变异，说明视网膜黄斑变性的风险略高于常人。在美国，大约10%的人患有此种疾病，Lauerman的妈妈也有。报告还提到了一个与精神分裂症风险增高相关的变异。对于这些，他都不以为然。

真正让Lauerman不安的是JAK2-V617F。JAK2基因变异体被归为“明确致病性的”，意思是有害的。这种变异经常在那些罕见、“癌症样（cancer-like）”血液疾病的患者中发现。尽管大部分可以治疗，但这不是个好消息。

三天之后，Lauerman走近了George Church的办公室。这位哈佛大学的遗传学家启动了个人基因组计划，并安排了这位记者的测序。（生物通注：George Church曾开发出新一代测序技术，目前已整合进ABI的SOLiD测序平台。）在场的还有Joseph Thakuria，该计划的医疗主管。两位科学家谈到了JAK2变异。

Thakuria谈到：“这可能是迄今为止我们在研究中发现的最严重变异。”大约千分之二的人有JAK2变异，这促使血细胞生长和分裂。这种变异体可用来诊断三种罕见的血液病，包括可能致命的原发性骨髓纤维化。Thakuria介绍了一项于2010年发表的研究，其中10,507名哥本哈根人提供了血液样本，并随访了18年之久。研究人员发现，18个人带有JAK2突变，其中14名最终发展成癌症，而在研究周期内这18人全都死亡。

当然，Thakuria也提到，他也不清楚这些人是否都是因诊断出的疾病而死。大部分人都活到了70多岁或80多岁。他开玩笑说，他们中的一半人也许死于交通事故。

这个答案让Lauerman非常不安。他在文中写道：“尽管我很高兴为健康研究作出贡献，但即使是专家也不知道答案。”

之后，Lauerman的报告被更新。他又多了一个名为“APOE-C130R”的变异，这也是ApoE4基因的另一个名字，它与阿尔茨海默氏症的风险增高相关。于是，他的担心又多了一成。

随着基因组测序的价格大幅下降，也许很快将会降至1000美元甚至更低。低廉的价格可能会促使它成为一个常规的诊断工具，或满足人们的某种好奇心。然而，即使我们知道了结果，那又能怎么样呢？在惴惴不安中度过余生？

在文中，美国国立癌症研究院的主管Harold Varmus就表达了这方面的担心。“我担心的是个体是否能就如何处理这些信息得到指导。”

John Lauerman的原文相当有趣且感人，有兴趣的童鞋可以读读。（生物通 余亮）

原文标题：

Genome Sequencing's Affordable, and Frightful, Future

Mapping My Genome Starts a Search for DNA Answers I May Not Want to Know

Harvard Mapping My DNA Turns Scary as Threatening Gene Emerges