第三代测序系统PacBio正式升级 读长达3K[新品推荐]

美国第三代测序公司Pacific Biosciences近日正式宣布其PacBio RS测序系统的重大升级（简称为C2试剂），这包括新的试剂、增强的SMRT Cell和升级的软件。与2011年4月发布的C1版本相比，此次发布的C2试剂和软件让片段平均读长显著提高，从过去的1300bp猛地提升至3000bp。

生物通报道 美国第三代测序公司Pacific Biosciences近日正式宣布其PacBio RS测序系统的重大升级（简称为C2试剂），这包括新的试剂、增强的SMRT Cell和升级的软件。所有这一切，将为客户带来显著的测序性能提升。

作为革命性的第三代测序系统，PacBio RS 在测序历史上首次实现了人类观测单个DNA聚合酶合成过程的梦想，让研究人员能够利用单个DNA聚合酶对天然DNA的合成进行大规模并行、连续的实时观察。与2011年4月发布的C1版本相比，此次发布的C2试剂和软件让片段平均读长显著提高，从过去的1300bp猛地提升至3000bp。此外，每个SMRT Cell的可定位数据也提高了3-4倍，而所需的起始DNA则减少了50-80%。

不少客户在试用了新版本的试剂之后，都给予了积极的评价，包括Wellcome Trust Sanger研究院和马里兰大学医学院的基因组科学研究所。

Wellcome Trust Sanger研究院研发部主管Harold Swerdlow博士表示：“Sanger研究院确实看到了性能的显著改善，这增强了我们在多个领域的研究，包括de novo基因组装配、重复元件的测序，并实现了极端碱基组成区域的覆盖。”

基因组科学研究所的Luke Tallon补充到：“与原先的C1试剂相比，新试剂让读长得到了显著改善。与短读取数据结合，这些更长的读取增强了我们微生物基因组的de novo基因组装配。”

Pacific Biosciences如今已开发出两个完整的产品方案，借助PacBio RS系统的能力来实现客户的主要应用：1）de novo全基因组装配和2）定向测序。例如，SMRT分析软件集成了Broad研究院开发的基因组分析工具箱（GATK）。这为定向测序的变异分析提供了一个简洁的通道。

到目前为止，单分子实时测序技术已成功应用在De Novo测序、靶向测序和修饰碱基测定等方面，在癌基因检测及个性化治疗方面也有文章发表。

今年2月，《Cell》杂志发表题为“癌症治疗决策的遗传基础（The Genetic Basis for Cancer Treatment Decisions）”的最新报道。文中，加拿大安大略省癌症研究所通过PacBio RS系统进行临床样本的癌基因及其它癌症治疗敏感/抗性相关的遗传标记的测定，辅助病人的后续治疗方案。该研究所已经通过先期测试积累了大量的经验和数据，正在加快后续大规模临床测试及以此为基础的个性化治疗的进程。

若您对PacBio RS的技术和应用感兴趣，可在4月18日下午前往广州凯旋华美达酒店，参加“第三代测序技术—PacBio单分子测序技术及其应用进展”技术交流会。届时来自美国的Pacific Biosciences技术专家将为您介绍最新技术和进展。（生物通 余亮）

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