Aqua Gen和综合基因组学中心(CIGENE)与Affymetrix合作开发三文鱼基因分型芯片[新品推荐]

【字体: 时间:2013年03月28日 来源:Affymetrix

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  Aqua Gen(Erich Wesjohann集团中的一员)和挪威生命科学大学综合基因组学中心(CIGENE)与Affymetrix公司今天联合宣布,他们将首次对大西洋三文鱼(Salmo salar)每个样品中的900,000多个标记进行基因分型,从而实现了Aqua Gen开展基因组选择并改善三文鱼育种计划的能力。

2013年3月19日,来自挪威Ås和美国加利福尼亚州圣克拉拉的消息——Aqua Gen(Erich Wesjohann集团中的一员)和挪威生命科学大学综合基因组学中心(CIGENE)与Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)今天联合宣布,他们将首次对大西洋三文鱼(Salmo salar)每个样品中的900,000多个标记进行基因分型,从而实现了Aqua Gen开展基因组选择并改善三文鱼育种计划的能力。

Aqua Gen是选择性育种方面的领头羊,管理了大规模的大西洋三文鱼选择性育种计划,成为世界上水产养殖的主要供应商。Aqua Gen还率先在水产养殖中采用分子标记辅助选择,推出了高度成功的QTL-innOva产品。位于挪威生命科学大学中的CIGENE开展一些研究项目,促进了对水产养殖和种植业中生物学的了解,它特别关注具有经济和生态意义的复杂性状的遗传学研究。Aqua Gen和CIGENE与Affymetrix合作,开发出三文鱼基因分型筛查芯片,这款芯片由923,627个SNP(单核苷酸多态性)标记组成,包含二倍体和四倍体序列变异。这项研究的目标是鉴定出相关且多态性的高分辨率标记,以便应用在下游的标记性状关联研究、基因组选择项目,以及各种各样的遗传学和生态学应用中。

Aqua Gen的研发部主管Nina Santi博士表示:“我们很高兴有机会在这么短的时间内获得第一张、也是突破性的大西洋三文鱼标记图谱。Aqua Gen一直在寻找能协助遗传材料开发的新技术,以满足不断增长的需求,实现具有成本效益且可持续的海产品生产。这款高密度的SNP芯片为改善人工养殖大西洋三文鱼的抗病能力和健壮性带来了全新的可能性。我们对在育种计划中实施所谓的基因组选择的前景十分看好。这款芯片将有助于与复杂性状相关的常见遗传变异的鉴定,从而大大推动我们对三文鱼生物学的了解。”

挪威生命科学大学(UMB)和综合遗传学中心(CIGENE)的教授兼助理主管Sigbjørn Lien博士认为:“现存三文鱼的共同祖先存在同源四倍体的全基因组复制,这使得SNP芯片的开发以及大西洋三文鱼的自动基因分型变得复杂。Affymetrix的生物信息学科学家小组提供了大量的设计支持和专业知识,极大地帮助了我们应对这些障碍。”

Affymetrix遗传分析和临床应用业务部的执行副总裁Andy Last博士则表示:“我们非常高兴与Aqua Gen和CIGENE合作,为他们提供我们在利用Axiom® 基因分型解决方案开展自动化基因分型上的经验。非二倍体物种中自动化的基因型检出带来了独特的优势,可将数据分析缩短至一小时,与过去相比速度提高90%,而无论SNP的数量有多少,从而更容易满足严格的育种期限,同时改善了准确性。”

Axiom 基因分型解决方案是唯一为育种人员和研究人员提供强大的基因分型工具和自动分析软件的平台,以便经济高效地鉴定、验证和筛查复杂的遗传性状。随着科学家们利用新一代测序平台不断解码各种人类疾病状态、植物和动物的基因组,他们可将那些发现转化成Axiom 基因分型解决方案平台上的常规应用,从而加速他们的研究和商业目标。

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请注意:Affymetrix®、Affymetrix的徽标、Axiom®、GeneTitan®及其他所有商标均为Affymetrix公司所有。其他所有商标均为其各自所有者所有。

本新闻稿中提及的产品仅供研究使用。不适用于诊断。

关于Aqua Gen
Aqua Gen AS(挪威特隆赫姆)是一个选择性育种公司,开发、生产并向全球海水养殖业提供遗传材料。通过以市场为导向的研究和开发,Aqua Gen已成为领先的大西洋三文鱼和虹鳟鱼受精卵供应商。自70年代开始收集这些鱼类以来,Aqua Gen通过与商业组织和研究机构合作,开展连续的研究与开发项目。以与健康、动物福利、生长和质量相关的遗传性状为重点,Aqua Gen为可持续发展且盈利的水产养殖业做出了突出贡献。

关于CIGENE
综合遗传学中心(CIGENE)正式成立于2003年,位于挪威生命科学大学Aas校区,距奥斯陆东南部30公里。在过去的十年中,CIGENE已成为挪威最重要的SNP基因分型机构,在分析多个物种的测序数据和开发SNP基因分型资源上积累了丰富的经验。自2007年以来,CIGENE已参与了大规模的测序项目,并开发出多个生物信息学分析管道,其重点是de novo拼接(如大西洋三文鱼基因组)和DNA标记的开发。

关于Affymetrix
Affymetrix技术被全球顶尖的制药、诊断和生物技术公司以及领先的科研、政府和非营利研究所使用。目前已有2,300多个芯片系统销往世界各地,并利用此技术发表了48,000多篇同行评审的论文。Affymetrix的总部位于美国加利福尼亚州的圣克拉拉,并在克里夫兰、俄亥俄和新加坡拥有生产基地。eBioscience的总部位于美国加利福尼亚州的圣地亚哥,并在圣地亚哥和奥地利维也纳拥有生产基地。包括eBiosciences在内,该公司在全球拥有约1,100名员工,其销售和分销业务覆盖欧洲、亚洲和拉丁美洲。关于Affymetrix的更多信息,请访问
www.affymetrix.com

如欲了解Axiom® 基因分型解决方案的更多信息,请访问www.affymetrix.com/agrigenotyping,了解在农业基因组学中的应用。

前瞻性声明
本新闻稿中所有非历史性声明均为符合不时修订的《证券交易法》第21E节所述含义的“前瞻性声明”,包括关于Affymetrix的“期望”、“信念”、“预期”、“打算”、“战略”等事项的声明。这些声明均受各种风险和不确定因素的影响,实际结果可能与Affymetrix所预测的情形有很大出入。Affymetrix在截至2011年12月31日的Form 10-K年报中以及其他SEC报告中说明了这些风险因素和其他因素。

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