Nature子刊发布大型癌症研究新成果

【字体: 时间:2013年05月14日 来源:生物通

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  来自宾夕法尼亚大学Perelman医学院的研究人员,在一项新研究中针对超过13,000人开展基因组检测,确定了与睾丸癌风险增高相关的4个新遗传变异。这一荟萃分析的结果报道在5月12日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

  

生物通报道  来自宾夕法尼亚大学Perelman医学院的研究人员,在一项新研究中针对超过13,000人开展基因组检测,确定了与睾丸癌风险增高相关的4个新遗传变异。这一荟萃分析的结果报道在5月12日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

发现这些遗传变异有可能最终帮助研究人员更好地认识高风险人群,以便尽早发现或是预防这一疾病。

医学系转化医学和人类遗传学部副教授Katherine L. Nathanson博士说:“随着我们继续扩大撒网,我们确定了其他的一些遗传风险因子,指出了疾病的新机制。由于我们知道这一疾病具有高度遗传性,一些与睾丸癌易感性相关的位点(loci),代表了一种有前景的将患者分为不同风险人群的方法。

通过挖掘3项全基因组关联研究(GWAS),包括生物统计学和流行病学系副教授Peter A. Kanetsky博士在内的研究人员,对931名患者和1,975名对照进行了分析,在另外3,211名癌症患者和7,591名对照中验证了研究结果。荟萃分析揭示,睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)的风险与4q22、7q22、16q22.3和17q22四个位点上的标记物显著相关,所有这些位点均未在其他研究中得到过确认。此外,相比于一些常见癌症,如乳腺癌和前列腺癌鉴别出的绝大部分其他位点,这些位点造成了更大的风险。

将发表在本期《Nature Genetics》杂志上另一项研究中报道8个新位点包括在内,与睾丸癌相关的基因组区域数量增加到了17个。

睾丸癌相对少见,但在过去的40年里其发病率翻了一番。并且它具有高度遗传性。如果一个男人他的父亲或儿子罹患有睾丸癌,相比于没有家族史的男性其形成睾丸癌的风险要高4-6倍。如果一名男性的兄弟患有睾丸癌,其风险要增高8-10倍。

鉴于此,研究人员一直在持续地调查遗传变异,以及它们与癌症的关系。

2009年,Nathanson和同事们发现围绕在KITLG和SPRY4两个基因周围的变异,与睾丸癌风险增高有关。这两种变异是第一批发现的引人注目的睾丸癌遗传风险因子。自那时以来,通过单项GWAS研究又发现了另外几个变异。

Nathanson博士说:“这一分析首次将数组数据整合到一起,来鉴别疾病相关位点。其表明将多个GWAS组合到一起,有能力更好地鉴别出单项研究无法达到全基因组意义的遗传风险因子。”

该研究小组还发现与癌症风险增高相关的基因变异,也与染色体分离相关。此外,存在基因附近的一些变异对于生殖细胞发育至关重要。这些数据强有力地支持了这一观点:即睾丸癌是一种生殖细胞发育和成熟障碍性疾病。

Nathanson 说:“睾丸生殖细胞肿瘤的独特之处在于,它的许多位点都是因为在雄性生殖细胞发育中起重要的作用,而成为极好的生物候选基因。雄性生殖细胞发育破坏,可导致肿瘤发生,也有可能导致不育。此前在流行病学上,这些疾病就显示出与我们从前研究中涉及的一些基因相关联,新研究增强了这种关联。”

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

Meta-analysis identifies four new loci associated with testicular germ cell tumor

We conducted a meta-analysis to identify new susceptibility loci for testicular germ cell tumor (TGCT). In the discovery phase, we analyzed 931 affected individuals and 1,975 controls from 3 genome-wide association studies (GWAS). We conducted replication in 6 independent sample sets comprising 3,211 affected individuals and 7,591 controls. In the combined analysis, risk of TGCT was significantly associated with markers at four previously unreported loci: 4q22.2 in HPGDS (per-allele odds ratio (OR) = 1.19, 95% confidence interval (CI) = 1.12–1.26; P = 1.11 × 10−8), 7p22.3 in MAD1L1 (OR = 1.21, 95% CI = 1.14–1.29; P = 5.59 × 10−9), 16q22.3 in RFWD3 (OR = 1.26, 95% CI = 1.18–1.34; P = 5.15 × 10−12) and 17q22 (rs9905704: OR = 1.27, 95% CI = 1.18–1.33; P = 4.32 × 10−13 and rs7221274: OR = 1.20, 95% CI = 1.12–1.28; P = 4.04 × 10−9), a locus that includes TEX14, RAD51C and PPM1E. These new TGCT susceptibility loci contain biologically plausible genes encoding proteins important for male germ cell development, chromosomal segregation and the DNA damage response.

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