Nature新文章:绘制癌症的基因组图谱

【字体: 时间:2013年05月03日 来源:生物通

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  由美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所领导,来自癌症基因组图集研究网络(Cancer Genome Atlas Research Network)的一项新研究,揭示了子宫内膜癌的基因突变。新研究发现有可能对罹患侵袭性子宫内膜癌的妇女的治疗计划,以及子宫内膜癌肿瘤分类产生直接的影响。

  

生物通报道  由美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所领导,来自癌症基因组图集研究网络(Cancer Genome Atlas Research Network)的一项新研究,揭示了子宫内膜癌的基因突变。新研究发现有可能对罹患侵袭性子宫内膜癌的妇女的治疗计划,以及子宫内膜癌肿瘤分类产生直接的影响。这项研究发表在5月2日的《自然》(Nature)杂志上。

研究人员利用微阵列(array)和测序技术,对来自373名患者的子宫内膜癌肿瘤样本进行了综合分析。他们发现,两种子宫内膜癌肿瘤亚型:子宫浆液性癌(uterine serous tumor)和高分级卵巢子宫内膜样肿瘤(endometrioid tumor)共同具有几种遗传突变。

研究人员发现,大约25%的分类为高分级卵巢子宫内膜样肿瘤的肿瘤,实际上具有与子宫浆液性癌相似的遗传特征,例如TP53基因广泛的拷贝数变异和频繁突变。此外,子宫浆液性癌还与卵巢浆液性癌(ovarian serous carcinomas) 和基底细胞样乳腺癌(basal-like breast carcinomas)共有一些遗传特征。

人们通常利用辅助放射疗法来治疗早期卵巢子宫内膜样肿瘤,而采用化疗来治疗相似阶段的子宫浆液性癌。基于这些令人注目的遗传相似性,研究人员指出,临床医生应该仔细考虑用化疗而不是辅助放射疗法来治疗拷贝数变异的卵巢子宫内膜样肿瘤,并在将来的临床实验中对这一假说进行正式的检测。

“该论文中报道的一些研究结果,可能会改变子宫内膜癌的分类方式,并为罹患这种癌症的患者提供机会测试新的治疗方案,”研究作者、Brigham和妇女医院遗传学及医学教授Raju S. Kucherlapati博士说。

对照当前将子宫内膜癌广泛的分为两种类型,研究人员通过进一步的分析并确定子宫内膜癌亚型的特征,提出将子宫内膜癌重新分为四个类型:POLE强突变(ultramutated),微卫星不稳定超突变(hypermutated),低拷贝数和高拷贝数。

 “这些研究发现提出了,具有不同的拷贝数变异和突变模式的子宫内膜癌亚类,其与传统的分级或肿瘤组织构成无关,”Kucherlapati说。

子宫内膜癌是发生于子宫内膜的一种癌症,在美国是第四大常见的女性恶性肿瘤,据估计2012年有47,000新发病例,有8,000人死于这一疾病。

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

Integrated genomic characterization of endometrial carcinoma

We performed an integrated genomic, transcriptomic and proteomic characterization of 373 endometrial carcinomas using array- and sequencing-based technologies. Uterine serous tumours and ~25% of high-grade endometrioid tumours had extensive copy number alterations, few DNA methylation changes, low oestrogen receptor/progesterone receptor levels, and frequent TP53 mutations. Most endometrioid tumours had few copy number alterations or TP53 mutations, but frequent mutations in PTEN, CTNNB1, PIK3CA, ARID1A and KRAS and novel mutations in the SWI/SNF chromatin remodelling complex gene ARID5B. A subset of endometrioid tumours that we identified had a markedly increased transversion mutation frequency and newly identified hotspot mutations in POLE. Our results classified endometrial cancers into four categories: POLE ultramutated, microsatellite instability hypermutated, copy-number low, and copy-number high. Uterine serous carcinomas share genomic features with ovarian serous and basal-like breast carcinomas. We demonstrated that the genomic features of endometrial carcinomas permit a reclassification that may affect post-surgical adjuvant treatment for women with aggressive tumours.


 

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