Nature医学：癌症抗原筛查新技术

　　

生物通报道  来自美国Moffitt 癌症中心的Jamie K. Teer博士和同事们，开发出了一种新的流线化方法，可快速鉴别出黑色素瘤中可被肿瘤浸润淋巴细胞识别的独特突变抗原。过去的研究证实肿瘤浸润淋巴细胞能够减少癌症病变，这些独特的蛋白小片段是肿瘤浸润淋巴细胞的识别靶标。研究人员将这一新方法发布在近期的《自然医学》（Nature Medicine）杂志上。

黑色素瘤是由异常黑素细胞过度增生引发的常见的皮肤肿瘤，恶性程度极高，占皮肤肿瘤死亡病例的极大部分。多发生于皮肤或接近皮肤的黏膜，也见于软脑膜和脉络膜。其发病率随人种、地域、种族的不同而存有所差异，白种人的发病率远较黑种人高。仅在2012年，美国的新增确诊病例据估计就有76,250人。根据美国国家癌症研究所统计，去年有9,180人死于此病。

此前的一项2期临床试验显示，70%的黑色素瘤患者接受自体肿瘤浸润淋巴细胞治疗，可导致转移病灶显著消退。

Teer 说：“在这一实验中，研究人员对患者过继转移了自身的免疫细胞，近40%的患者在至少5年的时间内肿瘤完全消退。为了更好地了解它的作用机制，我们开发了一种新方法，有助于更快地筛查出这些肿瘤浸润淋巴细胞识别的突变抗原。”

肿瘤浸润淋巴细胞是指那些离开血流进入到肿瘤中的白细胞。当存在大量的肿瘤浸润淋巴细胞时，表明机体启动了对抗肿瘤的免疫反应。在许多的癌症中，研究人员均开展了相关的研究，定量这些肿瘤浸润细胞，并将其数量与肿瘤特征和结果关联起来。

Teer认为，更好地了解肿瘤浸润淋巴细胞诱导癌细胞消退的机制，将提高患者自体移植细胞治疗的效力，并且有可能揭示出肿瘤生长新机制。新方法采用了新一代DNA测序技术，挖掘全外显子序列数据，鉴别在患者中表达的突变蛋白。随后研究人员合成出候选的突变T细胞抗原表位，并用一种主要组织相容性复合物结合算法对候选表位进行了评估。利用这种方法，研究人员鉴别出了在患者肿瘤细胞上表达，能被肿瘤浸润淋巴细胞识别的突变抗原。

Teer 说“我们的新技术使得我们能够更快、更容易地鉴别出免疫系统T细胞识别的突变基因抗原。从前，研究人员都是通过生成以及费力地筛查来自肿瘤的DNA库，来完成这样的工作。这一新筛查技术有可能还适用于在许多癌症类型中鉴别突变抗原。”

（生物通:何嫱）

生物通推荐原文摘要:

Mining exomic sequencing data to identify mutated antigens recognized by adoptively transferred tumor-reactive T cells

Substantial regressions of metastatic lesions have been observed in up to 70% of patients with melanoma who received adoptively transferred autologous tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) in phase 2 clinical trials1, 2. In addition, 40% of patients treated in a recent trial experienced complete regressions of all measurable lesions for at least 5 years following TIL treatment3. To evaluate the potential association between the ability of TILs to mediate durable regressions and their ability to recognize potent antigens that presumably include mutated gene products, we developed a new screening approach involving mining whole-exome sequence data to identify mutated proteins expressed in patient tumors……