NIBS朱冰实验室发表PLOS Genetics文章

【字体: 时间:2013年06月09日 来源:NIBS

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  2013年6月6日, NIBS朱冰实验室在《PLOS Genetics》杂志上在线发表题为“H3.3-H4 tetramer splitting events feature cell-type specific enhancers”的文章。这篇文章首次报道了组蛋白H3.3-H4四聚体拆分事件的全基因组分布情况,并发现H3.3-H4四聚体拆分事件富集于增强子。

  

2013年6月6日, NIBS朱冰实验室在《PLOS Genetics》杂志上在线发表题为“H3.3-H4 tetramer splitting events feature cell-type specific enhancers”的文章。这篇文章首次报道了组蛋白H3.3-H4四聚体拆分事件的全基因组分布情况,并发现H3.3-H4四聚体拆分事件富集于增强子。

组蛋白修饰是表观遗传信息的重要组成部分,其承载的表观遗传信息在细胞有丝分裂过程中的继承机制是表观遗传领域的重要问题和朱冰实验室的主要研究方向。

组蛋白H3-H4四聚体是核小体的核心组成部分,该四聚体在DNA复制中的分配模式是组蛋白修饰继承性研究的基本问题。朱冰实验室徐墨等人结合定量质谱技术与传统生物化学手段,在数年前澄清了四聚体分配方式这一长期争论的问题(Xu et al., Science. 2010)。该工作发现常规组蛋白四聚体通过全保留方式进行分配,并意外地发现一部分含组蛋白变体H3.3的H3-H4四聚体会发生拆分事件,产生含一分子“新”H3.3和一分子“旧”H3.3的混合型核小体。H3.3-H4四聚体的拆分事件是一个全新的发现,其机理和功能意义均未知。

在本研究中,朱冰实验室建立了一个可经双重诱导表达两种带不同标签组蛋白H3.3的HeLa稳定细胞系,通过控制两种外源H3.3的表达时序并利用双轮亲和纯化获得含一分子“新”H3.3和一分子“旧”H3.3的混合型单核小体,也即发生了拆分事件的H3.3核小体。然后通过DNA高通量测序,首次测定了组蛋白H3.3-H4四聚体拆分事件的全基因组分布谱,并发现H3.3-H4四聚体拆分事件显著富集于增强子。表明该事件可能参与增强子的功能调节。

NIBS与中国农业大学联合培养的黄畅博士以及朱冰实验室张珠强博士为本论文的共同第一作者,其他作者还有徐墨博士,李颖峰,李珍,马妍婷和蔡涛博士。朱冰博士为本文通讯作者。该研究由科技部、北京市科委和HHMI国际青年科学家项目资助,在北京生命科学研究所完成。

 

 

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