测序首次鉴定鲨鱼肝脏microRNA组

　　

条纹斑竹鲨（Chiloscyllium plagiosum），是主要栖息于沿海礁砂混合且海藻繁生的海床中的一种鱼类，卵生，对其生活习性我们还不甚了解，可能以底栖无嵴椎动物及小鱼为食。条纹斑竹鲨具有一定的经济价值，可在水族馆中展示，食用可治疗佝偻病、外痔、 水火烫伤、夜盲症等。microRNAs（miRNAs）是调控广泛的生物过程中不可或缺的成员，对条纹斑竹鲨进行miRNA研究有助于我们对这种神秘海洋物种的深入了解。近日，浙江理工大学副教授吕正兵领衔其团队，对条纹斑竹鲨肝脏中的miRNA组进行了系统研究*。

研究人员利用测序技术首次对条纹斑竹鲨肝脏中的小RNA，特别是miRNAome进行深度挖掘（小RNA测序技术服务由联川生物提供）。测序发现，其中91个miRNAs，这些miRNA已在斑马鱼，红鳍东方鲀，青鳉，非洲爪蟾，热带爪蟾，人类，小鼠中报道，可以比对到Callorhinchus milii基因组。此外，研究人员鉴定到156个新的候选条纹斑竹鲨miRNA。从这247个miRNAs中，研究人员一共鉴定得到39个miRNAs簇，并且观察到这些簇的表达显著不同。研究人员进一步挑选了其中7个候选miRNAs，采用茎环RT-PCR对其表达进行验证，结果显示所有7个都在条纹斑竹鲨肝脏中有表达。

本研究结果，为进一步研究miRNA在条纹斑竹鲨肝脏发育过程中的调控作用奠定了基础。

*Zhang J, Liu Y, Zhang X, Pan J, Nie Z, Zhang W, Yu W, Chen J, Liu L, Li J, Zhang Y, Guo J, Wu W, Zhu H, Lv Z.(2013) The identification of microRNAs in the whitespotted bamboo shark (Chiloscyllium plagiosum) liver by Illumina sequencing. Gene. [abstract]

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