上海交大首席科学家Cancer Res解析非编码RNA

来自上海交通大学、卫生部胃肠病学与肝病学卫生部重点实验室和密歇根大学的研究人员在新研究中证实，一种叫做GAPLINC的非编码长链RNA调控了CD44依赖性的细胞侵袭，并与胃癌的不良预后相关。这些研究发现发表在12月1日的《癌症研究》（Cancer Research）杂志上。

　　

生物报道  自上海交通大学、卫生部胃肠病学与肝病学卫生部重点实验室和密歇根大学的研究人员在新研究中证实，一种叫做GAPLINC的非编码长链RNA调控了CD44依赖性的细胞侵袭，并与胃癌的不良预后相关。这些研究发现发表在12月1日的《癌症研究》（Cancer Research）杂志上。

上海交通大学医学院211工程重点学科首席科学家房静远(Jing-Yuan Fang)教授和许杰（Jie Xu）博士是这篇论文的共同通讯作者。房静远教授的主要研究方向为消化系肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗。曾在国际上首次发现叶酸可以治疗慢性萎缩性胃炎而预防胃癌，且其作用机制与DNA甲基化的维持有关。

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一组长度大于200个核苷酸、缺少特异完整的开放阅读框、无蛋白质编码功能的RNA,在总非编码RNA(ncRNA)中占有相当大的比例。因其数量、种类、功能状况均不明确,被称为基因组中的"暗物质"。

在我国，胃癌是一种高发病率、低生存率的恶性肿瘤之一。与其他肿瘤类似，编码基因与非编码基因的异常表达参与了胃癌的发生、发展。近年来的研究表明， lncRNA作为一种新型的非编码RNA，与肿瘤发生、发展有着密切的关系，但它们与胃癌的关系尚未完全阐明，对于胃癌相关lncRNA还知之甚少。

在这篇文章中研究人员报告称，通过采用生物芯片分析（免费索取康成生物Arraystar LncRNA芯片资料）和原位杂交(ISH)分析来鉴别在人类胃癌样本中异常表达的lncRNA，发现了一种与胃癌相关的新型lncRNA，将之命名为GAPLINC。GAPLINC是一种长度为924bp的lncRNA，其高水平表达于胃癌组织中。通过抑制GAPLINC结合胃癌细胞基因表达谱分析，研究人员揭示出一些与CD44的表达最高度相关的细胞迁移信号通路发生了改变。他们证实，操控GAPLINC表达可改变CD44 mRNA丰度，而抑制CD44的表达则可消除GAPLINC对于细胞迁移和增殖的影响。

进一步的机制研究证实，GAPLINC是作为miR211-3p的分子诱饵（molecular decoy）调控了CD44，CD44和GAPLINC均是miR211-3p的靶标。组织ISH分析结果显示，GAPLINC过表达与预后极差的一群胃癌患者相关联。

这些研究结果揭示出了CD44癌基因的一条非编码调控信号通路，并阐明了胃癌细胞侵袭的分子基础。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Long Noncoding RNA GAPLINC Regulates CD44-Dependent Cell Invasiveness and Associates with Poor Prognosis of Gastric Cancer

It is increasingly evident that long noncoding RNAs (lncRNA) have causative roles in carcinogenesis. In this study, we report findings implicating a novel lncRNA in gastric cancer, termed GAPLINC (gastric adenocarcinoma predictive long intergenic noncoding RNA), based on the use of global microarray and in situ hybridization (ISH) analyses to identify aberrantly expressed lncRNA in human gastric cancer specimens. GAPLINC is a 924-bp-long lncRNA that is highly expressed in gastric cancer tissues……

作者简介：

房静远

上海交通大学医学院附属仁济医院消化科主任、大内科主任，主任医师、教授

工作经历
在包括仁济医院等长期从事消化系疾病诊治的临床工作近30年,在胃肠病特别是胃癌癌前疾病慢性萎缩性胃炎和胃息肉,大肠癌及其癌前疾病腺瘤的诊断和治疗与预防中积累有经验.

科研经验
先后作为第一负责人承担了包括973课题、863课题、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金杰青项目和面上项目等超过15项、还承担了国家“十一五”卫生公益行业基金项目1项，作为共同负责人承担一项国家“十一五”新药研发重大项目。发表论文270篇，其中SCI论文全文（不包括会议摘要）116篇（第一或通讯作者发表97篇），包括Science、Lancet Oncol、Gastroenterology、JNCI、J Virol、J Immunol、Am J Epid、Carcinogenesis、JBC、Neoplasia 、J Pathol、Int J Cancer、Am J Clin Nutr、Mol Cancer Ther等。以第1完成人获2008年国家科技进步二等奖、2013年教育部高校科学研究优秀成果奖（科技进步）一等奖、2007年中华医学科技一等奖和2005年上海市科技进步一等奖