适用于分子诊断领域的自动化核酸提取系统

【字体: 时间:2014年03月13日 来源:基因有限公司

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  近年来,我国分子诊断市场每年的增速高达20%以上,是全球增速的2倍,随着分子诊断技术覆盖越来越多的临床科室,法医及第三方检测实验室等相关机构,其初始的核酸提取步骤也变得尤为重要,因为这一步得到的核酸质量直接关系着整个实验结果的真实性及准确性。本文就为您介绍一款特别适用于分子诊断领域的核酸提取设备—LabTurbo系列全自动核酸纯化系统。让我们通过一些实例的分享,看一看这款仪器在该领域的实际表现。

  手工核酸提取对于实验室来说一直是沉重的负担,同时伴随的可能是不知不觉中错误的发生。对于临床样本来说,每个样本都是非常宝贵的,而由于人和人之间样本的差异性,这种错误就更难被发现的。有鉴于此,自动化提取设备就是一个很好的解决方案。但核酸提取过程中含有大量的繁琐步骤,大部分的自动提取设备功能不够完全,不能满足这些繁琐步骤对仪器的需求,仍然需要手工操作来弥补自动化的短缺,如液体处理,预热解,以及繁琐耗时的工作台准备。而LabTurbo系列核酸纯化系统对于用户来说可谓是一台近乎完美的核酸提取设备,它可以全自动的完成从样本裂解到提取的全过程。此外,其附加的其他功能:如采血管兼容、广泛的临床样本兼容、超声探头检测、紫外灭菌、自动试剂计算机补给等可以说完全针对临床样本的特点而设计,还能帮助完成提取前样本转移及提取后台面清理等工作,完全解放劳动力。

  样本兼容类型:

新鲜/冻存血液,血细胞,白膜层,羊水、绒毛组织、脐带血、无创产前检测孕妇外周血、FFPE样本、培养细胞,血浆,血清,培养基,尿,痰,粪便,支气管肺泡灌洗(BAL),滑膜液,口腔拭子,咽拭子,阴道拭子等。

*Let Professionals Serve Professionals基因有限公司 www.genecompany.com*

  分子诊断案例分享:

A.孕妇母体中游离核酸的提取

  研究证明,怀孕过程中,胎儿游离核酸会释放到母体的血液中,通过分析胎儿游离核酸与母体本身的游离核酸的比例可以较为准确的预测胎儿患唐氏综合症及13,18三体等染色体综合征的概率。香港用户采用LabTurbo系统取代人工方法用于母体游离核酸分离。

B.以全血/羊水/绒毛膜为起始样本用于染色体芯片 

  某知名妇产儿童医院LabTurbo系统上分别验证了仪器对于新鲜/冻存全血、血浆、羊水、绒毛膜等妇产相关临床样本的提取效果,其抽提出的核酸质量满足其下游多种应用,这些应用包括:孕妇外周血中胎儿游离DNA进行NGS无创产前检测、用羊水及绒毛膜中的DNA进行基因芯片染色体综合征检测、下游其他PCR检测。

C.用于莱姆病诊断—该方法已通过FDA对于莱姆病新药开发提取方法的认证

  美国科学家已经采用LabTurbo系统提取莱姆病人血液中的病原核酸,与其他自动化核酸纯化系统相比较,该系统可大大提升检出率,即使亿分之一病原感染,都可以有高达98%的检出率。

D.比较三种自动化核酸提取系统用于粪便中诺罗病毒的检测

  诺罗病毒(Norovirus)是引起非细菌性腹泻爆发的主要病因,容易在医院、学校等场所集中爆发,形成公共卫生事件。但因为粪便中含有大量难以去除的抑制PCR等反应的抑制物,会造成伪阴性,大大降低该病毒的临床检出率。而且经常需要重复操作,严重影响检测时效,也造成人力及试剂的浪费,所以选择适当的提取系统非常重要。该实验评估了三种不同的自动化核酸提取系统,以housekeeping genes(GAPDH)作为internal control分析有无PCR抑制现象;以RT-PCR检测粪便中诺罗病毒的阳性率,并且將不同品牌所提取的核酸进行稀释,进行三个系統的敏感度比較。最后比较三种提取试剂在提取量、洗脱体积及核酸自动化系统所花费的时间,以供临床实验室选择。A:TAIGEN-滤膜法、B:Roche-磁珠法、C:Formosa biomedical-磁珠法分別提取RNA。

  台北长庚医院用户证明,经过三家核酸提取平台及试剂的比较, Taigen能够兼容的样本量多余其他两家,且需要的时间仅为50min,效果最佳。采用LabTurbo技术可以完全去除粪便中的抑制物,有效获得病毒核酸,能够100%检出诺罗病毒感染者,检出率远高于参与比对的磁珠法核酸纯化系统(上表M及F Automation。)

E.用于临床拭子/法医等固态样本

LabTurbo系统在台湾已经广泛应用于临床和法医样本的核酸提取,得到广泛赞誉。只需4步:

•Step1-将拭子等固体样本剪下

•Step2-将样本直接置于样本管中

•Step3-将LabTurbo配置的六联管捣柱置于样本管中

•Step4-将管子置于机器中,设置程序后,抓手会自动抓住捣柱进行上下捣动以使核酸释放。

  更有多种试剂盒适用于各种临床样本的DNA/RNA抽提。详询基因有限公司。

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如需更多信息,请联系基因有限公司各办事处(www.genecompany.com)。

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