transOMIC重拳推出新生代NGS靶向富集产品——TargetRich®

【字体: 时间:2014年03月14日 来源:

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  TransOMIC的新产品TargetRich®是专门为靶向富集而生的一款新生代靶向捕获产品。真正的一管操作,基于巢式PCR技术经两步PCR富集过程加之两步纯化步骤,1.25小时手工操作即可完成靶向富集的上机测序文库构建。省时省力省心的设计,真正贴心的产品形式,对靶向区域的高效击中捕获,适用于低DNA含量样本,提供量身定制的客户需求产品,产品的多种优势使其成为一款性价比非常高的靶向富集产品选择。

靶向富集,也称为定向重测序、基因组划分或DNA捕获,在研究人员只对基因组的某个特定区域感兴趣时相当有用。靶向富集已成为在癌症等复杂性疾病研究中用以识别遗传变异的强有力工具。目前常用的靶向富集手段有杂交探针或者PCR方法来富集基因组上的蛋白编码区,然后进行深度测序。但这些靶向富集方法大多都不能实现对靶向区域的高特异性、高覆盖范围和测序一致性的富集,而这些因素在对靶向区域的研究分析中都是至关重要的。即使目前有针对各靶向区的多步独立PCR技术来解决上述问题,但是成本高、有特殊仪器要求且高起始DNA样本量成为了该技术的限制因素。

Nested Patch PCR™ (巢式补丁PCR,Varley and Mitra 2008, Varley and Mitra 2009)为二代测序对靶基因的重测序或者特定外显子分析提供了新的思路。TargetRich®应用巢式补丁PCR技术可同时对多个样本的多个靶向区域进行筛选,是二代测序(NGS)靶片段富集的有效解决方案。该技术依托于两轮靶向特异性的富集、两轮富集过程间独立的纯化过程来实现对NGS后续分析更特异的靶向富集和扩增。 它取代了其他耗时耗力的定向重测序方法,突破了大部分新一代测序流程中的主要瓶颈。该技术革新使得对多种遗传变异(比如SNPs,插入缺失等)及表观遗传学修饰的快速检测成为可能。

*Let Professionals Serve Professionals基因有限公司 www.genecompany.com*

TargetRich®的几大优势:
• 高效的靶向“击中”捕获效率——对靶向区域的100%覆盖,对靶向区域数据的高效捕获
• 质量保证——定制产品在出厂前都经NGS确认
• 省时——1.25小时人工操作时间,减少人为误差引入
• 省力——单管操作,简便快速,多步操作一管完成
• 省心——根据客户感兴趣的靶向区域灵活定制相关产品
• 适用于10-250ng起始量样本,FFPE样本普适
• 可扩展性应用,通量—可同时进行1‐96个低DNA含量样本的检测

TargetRich®富集流程


 
TargetRich®巢式补丁PCR是一种高效多重特异性PCR, 工作流程简单,只需两步靶向富集反应便可实现对突变、SNPs以及其他靶向区域的灵敏性捕获。该项技术也可以拓展应用于对多个基因组区的靶向区域进行高效“击中”捕获和序列解读分析。它操作简单,很容易扩展到96孔的形式;它比芯片或PCR等方法需要更少的基因组DNA;特异性极佳。实际上,它所需的DNA起始量只有其他平台的十分之一,因此对于珍贵样品(如FFPE样本)而言是再适合不过了。

TransOMIC的TargetRich®现有产品有:癌症研究CRX产品,提供了涵盖COSMIC数据库中10个*常见研究基因( BRAF, EGFR, FLT3, JAK2, KIT, KRAS, PIK3CA, PTEN, TP53 and VEGFA )155个外显子的产品 ;乳腺癌BRCA1/2产品,将BRCA基因1和2作为靶向进行捕获设计。TransOMIC的CRX产品系列在对FFPE样本和常规样本的靶向富集后续分析中展示了高达99.8%的测序覆盖范围以及在不同样本间的捕获一致性,产品性能稳定,测序重现性极佳;BRCA1/2产品系列在对FFPE样本和常规样本的靶向富集中也展示了高度的重现性,对靶向区域的完全覆盖性和数据读取的一致性,测序读数覆盖了目标区域的100%,而98%的目标碱基都至少有一次读取。目前的定制产品*大设计区间长为121kb,但这并未是TargetRich®的*大设计极限。产品量身定制,助您马到成功。更多精彩和成功等待您跟TransOMIC的共同努力!

现有目录产品的性能测试结果表明,CRX产品和BRCA1/2产品在对靶向区域的捕获过程中均实现了对靶向区域的100%覆盖,对靶向区域数据的高效捕获。


 
Transomic的定制产品同样显示了卓越的性能:目前设计的*大定制产品的范围涵盖65个基因815个外显子的1215个扩增子121kb的长度区间。但这并未是TargetRich®的定制产品极限。

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如需更多信息,请联系基因有限公司各办事处(www.genecompany.com)。

 

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