Nature子刊：绘制首张鼻咽癌全基因组景观图

　　

生物通报道  来自新加坡国立大学癌症科学研究院（新加坡CSI）、国立大学癌症研究所(NCIS)和国立大学医院的科学家们组成的一个研究小组，发现了与鼻咽癌相关的1个独特突变标记以及9个显著的突变基因，从而为开发出针对这一致命性疾病的新疗法铺平了道路。

在新加坡CSI资深首席研究员、NCIS副所长H. Phillip Koeffler教授的领导下，该研究小组成功完成了对鼻咽癌的首次全基因组研究。鼻咽癌是一种发生于鼻咽粘膜的恶性肿瘤，在中国的南方和包括新加坡在内的东南亚地区尤其具有较高的发病率（延伸阅读：中山大学首席科学家Nature子刊发表癌症新文章  ）。新研究结果为研究这一癌症形式的分子基础提供了一张增强版的线路图。

这项研究在线发布在6月23日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。

鼻咽癌起源于鼻后、咽喉上部鼻咽的粘膜上皮。不同于乳腺癌和结肠癌这些已得到广泛研究的癌症，当前对于鼻咽癌分子生物学的认识有限。到目前为止，还没有建立任何的靶向性疗法，因而迫切需要一张全面的基因组景观图来引导开发出新疗法。

在这篇文章中，研究人员通过先进的生物学技术对100多名新加坡鼻咽癌患者的基因组DNA和蛋白质进行了分析。研究揭示出，许多的基因在鼻咽癌细胞中发生了突变和功能失调，其中一些引起并加重了这一疾病。分析结果还显示，许多遗传损伤影响了几个重要的细胞过程和信号通路。通过这项全面的研究还揭示出了一些药物可及的新型候选靶点。

论文的第一作者、新加坡CSI研究人员Dechen Lin博士说：“由于鼻咽癌在美国和欧洲非常少见，这一恶性肿瘤有些被忽视。然而，这一疾病在东南亚，尤其在新加坡却特别常见。我们当前的研究对于鼻咽癌研究，特别是为患者鉴别出个体化靶向疗法具有直接的转化意义。”

Koeffler教授说：“我们想要增进对鼻咽癌病因学和生物学的理解，希望能够改进诊断、预测和治疗，由此促进新加坡人的健康。通过在单核苷酸水平上完全解译所有的人类基因，我们当前的结果为研究这一恶性肿瘤的潜在分子机制奠定了重要的基础。更为重要的是，我们的分析结果揭示出了许多潜在的治疗药物，其中一些已用于治疗其他类型的肿瘤。因此，这些结果有潜力迅速推动开发出针对鼻咽癌患者的新治疗策略。”

在发现了鼻咽癌中这些从前未知的遗传缺陷后，Koeffler教授和他的研究小组将在下一阶段的研究中探究这些缺陷的详细分子机制。论文的作者、NCIS的Loh Kwok Seng教授、新加坡CSI和NCIS的副教授Goh Boon及副教授Lee Soo Chin，则将在临床中评估是否能够利用其中的一些遗传缺陷来有效治疗这一疾病。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

The genomic landscape of nasopharyngeal carcinoma

Nasopharyngeal carcinoma (NPC) has extremely skewed ethnic and geographic distributions, is poorly understood at the genetic level and is in need of effective therapeutic approaches. Here we determined the mutational landscape of 128 cases with NPC using whole-exome and targeted deep sequencing, as well as SNP array analysis. These approaches revealed a distinct mutational signature and nine significantly mutated genes, many of which have not been implicated previously in NPC. Notably, integrated analysis showed enrichment of genetic lesions affecting several important cellular processes and pathways, including chromatin modification, ERBB-PI3K signaling and autophagy machinery. Further functional studies suggested the biological relevance of these lesions to the NPC malignant phenotype. In addition, we uncovered a number of new druggable candidates because of their genomic alterations. Together our study provides a molecular basis for a comprehensive understanding of, and exploring new therapies for, NPC.