安徽医科大学Nature子刊发表银屑病新成果

【字体: 时间:2014年07月11日 来源:生物通

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  来自安徽医科大学、复旦大学附属华山医院、华大基因研究院等处的研究人员,通过基于测序的方法鉴别出了3个新的银屑病易感基因位点。相关论文发表在7月9日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

  

生物通报道  来自安徽医科大学、复旦大学附属华山医院、华大基因研究院等处的研究人员,通过基于测序的方法鉴别出了3个新的银屑病易感基因位点。相关论文发表在7月9日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

安徽医科大学的张学军(Xuejun Zhang)教授、孙良丹(Liangdan Sun)副教授和香港中文大学的徐雷(Lei Xu)教授是这篇论文的共同通讯作者。

银屑病俗称牛皮癣,是一种复杂的、慢性、终身自身免疫炎症性皮肤病.它通常好发于15-35岁人群,也可以在任何年龄段发病,其中包括孩子。以皮肤出现大小不等,境界清楚的红斑鳞屑性斑块,上覆大量干燥的银白色鳞屑为特征。其中的脓疱型和红皮病型等特殊类型病情严重,甚至危及生命;关节病型可引起各关节的畸形,是所有关节炎中致残最为严重的。目前尚无有效的治疗方法,往往症状缓解后复发,且复发时病情加重(延伸阅读:Science医学:揭示银屑病治疗新靶点)。这种可怕的疾病是由于环境、遗传和免疫等多种因素相互作用的结果。快速、廉价的测序技术使得研究人员能够深入挖掘大量与银屑病风险相关联的突变。

张学军教授长期致力于皮肤遗传病,特别是复杂性皮肤遗传病的研究,取得了一系列突出的成果。他不仅建立了目前世界上较为完整的皮肤病遗传资源库,收集和储存了近15万份皮肤病样本和资源,而且接连在Nature Genetics等杂志上发表文章,发现了白癜风、系统性红斑狼疮和麻风等一系列的易感基因,这对于国内皮肤病遗传学研究起到了奠基性的作用。

在以往的一项针对银屑病的大规模外显子组测序研究中,张学军课题组与华大基因研究院等机构合作,发现了6个基因中7种常见及低频的错义变异(missense variants)达到了全基因组关联显著性水平。在这篇新文章中研究人员报告称,他们基于对两组独立的中国汉族人测序数据进行非编码变异深度分析,鉴别出了另外一些银屑病易感基因位点。第一组的测序数据包括10,727名银屑病患者和10,582名对照人群。第二组则包括4,480名银屑病患者和6,521名对照者。

除证实了4个已知的银屑病易感基因座IL12B、IFIH1、ERAP1和RNF114之外,研究人员还发现了3个新的易感基因位点:4q24 (NFKB1) at rs1020760 (P=2.19 × 10−8), 12p13.3 (CD27-LAG3) at rs758739 (P=4.08 × 10−8)和17q12 (IKZF3) at rs10852936。此外,还鉴别出了两个P<1.00 × 10−6的预示位点。

这些研究结果增加了证实的银屑病风险位点的数量,进一步丰富了银屑病的发病机制,对于全面了解银屑病奠定了坚实的理论基础,也为疾病预警、遗传咨询和新药研发提供了空间。

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

Sequencing-based approach identified three new susceptibility loci for psoriasis

In a previous large-scale exome sequencing analysis for psoriasis, we discovered seven common and low-frequency missense variants within six genes with genome-wide significance. Here we describe an in-depth analysis of noncoding variants based on sequencing data (10,727 cases and 10,582 controls) with replication in an independent cohort of Han Chinese individuals consisting of 4,480 cases and 6,521 controls to identify additional psoriasis susceptibility loci. We confirmed four known psoriasis susceptibility loci (IL12B, IFIH1, ERAP1 and RNF114; 2.30 × 10−20≤P≤2.41 × 10−7) and identified three new susceptibility loci: 4q24 (NFKB1) at rs1020760 (P=2.19 × 10−8), 12p13.3 (CD27-LAG3) at rs758739 (P=4.08 × 10−8) and 17q12 (IKZF3) at rs10852936 (P=1.96 × 10−8). Two suggestive loci, 3p21.31 and 17q25, are also identified with P<1.00 × 10−6. The results of this study increase the number of confirmed psoriasis risk loci and provide novel insight into the pathogenesis of psoriasis.

 

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