南农大：测序揭示miRNA调控铅胁迫应答

　　

萝卜是一种重要的根菜类蔬菜作物，其肉质直根为可食用部分。重金属胁迫对萝卜的种植和生产有重大影响。越来越多的证据显示，microRNA（miRNA）介导的基因调控在重金属胁迫应答中起着重要作用。不过，目前几乎没有信息是关于在铅毒性应答时植物miRNA的表达模式或调控作用的。南京农业大学柳李旺教授带领的研究团队从分子水平上对萝卜在铅（Pb）胁迫下的调控网络和反应机制进行了研究*，研究成果发表在7月刊的Plant Molecular Biology Reporter上。

研究人员通过高通量测序和降解组分析（降解组测序项目由联川生物承担完成），对Pb胁迫下的萝卜进行了全基因组水平的miRNA鉴定并探讨了miRNA调控的靶基因。实验从两个萝卜根文库中（一个是未经处理的萝卜根，另一个是Pb胁迫的萝卜根）共鉴定出74个已知的和173个潜在的新miRNAs。其中，25个已知的和9个新发现的miRNAs有显著差异表达，并鉴定为Pb应答miRNAs。降解组分析显示，1979对miRNA-mRNA靶向转录本很有可能被剪切。GO分析表明，这些靶向转录本主要参与转录调控，防御反应和结合相关的功能。Pb应答miRNAs调控的靶基因主要参与胁迫相关信号的感知和传导，特定金属的吸收，以及体内平衡机制。另外，研究人员通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术，对20个Pb应答miRNAs和6个靶基因的表达模式进行了验证。

此研究结果表明，miRNA在Pb胁迫时，发生显著地差异表达，在Pb应答过程中起到调控作用。研究结果也为植物应答Pb胁迫时miRNA介导的调控网络和分子机制提供了基本见解。

*Yan Wang, Wei Liu, Hong Shen, et al.Identification of Radish (Raphanus sativus L.) miRNAs and Their Target Genes to Explore miRNA-Mediated Regulatory Networks in Lead (Pb) Stress Responses by High-Throughput Sequencing and Degradome Analysis (2014) Plant Molecular Biology Reporter. doi: 10.1007/s11105-014-0752-y [article]

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