医学科学院赫捷院士Nature子刊绘制癌症遗传图谱

　　

生物通报道  来自中国医学科学院的研究人员采用外显子组测序，绘制出了食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma，ESCC）的遗传图谱。研究结果发表在8月24日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。

领导这一研究的是中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所的赫捷（Jie He）教授。其长期从事肺癌、食管癌等胸部肿瘤疾病的早诊早治、外科治疗及综合治疗，并在食管癌、肺癌综合治疗大型研究中取得较大成果。于2013年当选为中国科学院院士。

食管癌是最具侵袭性的癌症类型之一，是全球第六位的主要癌症死亡原因。近70%的全球食管癌病例发生在中国，绝大多数病例(>90%)的组织病理形式是食管鳞状细胞癌（ESCC）。目前，ESCC的早期临床诊断及治疗方法有限，患者的5年生存率仅为10%。直到现在对于导致ESCC发病的完整基因组事件仍知之甚少（林东昕院士等Nature子刊发表癌症GWAS研究新成果 ）。

外显子组测序 （Exome sequencing）是近年发展起来的一种利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。是一种选择基因组的编码序列的高效策略，相对于基因组测序其成本较低。目前，外显子组测序已经在米勒综合症、歌舞伎综合症、重型颅脑畸形等孟德尔疾病的研究中得到成功应用。还有其它一些癌症和复杂性疾病也应用外显子组测序观察到高度相关的突变。

在这篇新文章中，研究人员对113对肿瘤和正常样本以及8种细胞系进行了外显子组测序，每个肿瘤平均生成了82个非沉默突变（non-silent mutation）。他们证实食管鳞状细胞癌的突变谱与其他组织鳞状细胞癌的突变谱非常相似，但却不同于食管腺癌的突变谱。在99%的病例中一些与细胞周期和凋亡调控的基因发生了体细胞突变，其中包括TP53 (93%)、CCND1 (33%)、CDKN2A (20%)、NFE2L2 (10%)和RB1 (9%)基因。包括KMT2D（也称作MLL2; 19%)、KMT2C (MLL3; 6%)、KDM6A (7%)、EP300 (10%)和CREBBP (6%)在内的一些组蛋白修饰基因频繁突变。EP300突变与不良的生存预后相关。FAT1、FAT2、FAT3或FAT4突变(27%)和AJUBA突变(JUB; 7%)导致了Hippo信号通路失调，而NOTCH1、NOTCH2或NOTCH3突变(22%)及FBXW7突变(5%)则破坏了Notch信号通路。

这些研究结果详细描绘出了食管鳞状细胞癌的突变景观，表明了一些表观遗传调控因子突变有可能具有潜在的预后及治疗意义。

（生物通：何嫱）

作者简介：

赫捷

男，1960年8月出生。主任医师，博士生导师。中国科学院院士。现任中国医科院肿瘤医院院长，肺癌中心主任、手术委员会副主任、胸外科主任。赫捷教授1984年毕业于白求恩医科大学医学系，同年分配至中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所胸部肿瘤外科参加工作，1988年至1993年在中国协和医科大学攻读硕士、博士学位，1995年至1997年赴美国俄亥俄大学医学院和印第安纳大学医学院从事博士后工作。

赫捷教授长期以来主要从事肺癌、食管癌等胸部肿瘤疾病的早诊早治、外科治疗及综合治疗，具有丰富的临床经验和精湛的手术技术，对胸部肿瘤的综合治疗有独到的见解，引领食管癌、肺癌综合治疗的大型研究，并取得较大成果。在胸部肿瘤的基础研究，特别是肺癌、食管癌的相关基因研究，分子分期、分型和分子预后方面，赫捷教授所领导的团队亦取得了一系列的研究成果。建立了转化医学的平台，形成了临床研究与基础研究密切结合的研究特色。赫捷教授承担包括国家十一五科技支撑计划肺癌综合治疗研究项目在内的多项国家级、省部级科研项目，目前致力于在全国范围内开展肺癌综合治疗的多中心合作临床研究。得到了国家重点学科建设基金，国家自然科学基金，863重点基金，国家科技支撑计划等基金支持。赫捷教授在cancerresearch等杂志上发表SCI论文多篇，获专利成果4项，其工作得到了国际同行的认可。

生物通推荐原文摘要：

Genetic landscape of esophageal squamous cell carcinoma

Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is one of the deadliest cancers1. We performed exome sequencing on 113 tumor-normal pairs, yielding a mean of 82 non-silent mutations per tumor, and 8 cell lines. The mutational profile of ESCC closely resembles those of squamous cell carcinomas of other tissues but differs from that of esophageal adenocarcinoma……