序列分析/生物信息学的十个手机应用程序

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2014年08月11日 来源:生物通

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  2014年8月8日,BioTechniques为进行测序和生物信息学分析的研究人员,提出了一系列可以在移动设备上运行的软件,让你的基因组研究变得更加便捷而有趣。了解更多……

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生物通报道:2014年8月8日,BioTechniques为进行测序和生物信息学分析的研究人员,提出了一系列可以在移动设备上运行的软件,让你的基因组研究变得更加便捷而有趣。了解更多……

1、 DNAApp: iPhone/iPad / Android

现在,你可以在你的移动设备上使用这个方便的小程序,查看和分析DNA测序电泳图(以.ab1文件格式)。

2、 BioGene: iPhone/iPad

BioGene是一种简单而直观的工具,通过搜索基因的符号或名称,获得关于一个基因的功能信息。

3、 mentha - the interactome browser: Android

mentha interactome浏览器的一个便携式版本,利用各种专业数据库汇集的数据,显示目的蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(直接和酶催化)。

4、 GeneIndex: iPhone/iPad


GeneIndex提供了一种快速简便的方法,从不同的基因指标获得关于基因的信息。它也有一个PubMed查看器和RSS阅读器供杂志订阅。

5、 Genome Voyager: iPad


这个应用程序提供了方便的使用,收集整个人类基因组序列,使研究人员能够可视化全基因组测序数据,并了解如何分析它们发现序列变异、拷贝数变化和杂合性缺失事件。

6、 YeastGenome: iPhone/iPad


用YeastGenome应用程序,寻找关于啤酒酵母(Saccharomyces cerevisae)基因和染色体特征的信息,这个程序使用来自酵母属(Saccharomyces)基因组数据库(SGD)的最新数据。

7、SNPdbe: iPhone/iPad 


用这个程序访问SNP数据库SNPdbe,以获得单一氨基酸置换结构和功能影响的实验和计算派生注释。

8、SimGene: iPhone/iPad / Android


通过与各种数据库相连接,如Simbiot、Ensembl、NCBI、Gene Ontology、PubMed等,这个应用程序提供了来自30多个物种基因的最新注释,它还包括一个基因组浏览器,可显示基因、转录本、外显子和SNPs的信息。

9、TimeTree: iPhone/iPad


利用来自科学文献的分子钟估算,探索不同生物的分歧时间,了解地球上生命的进化时间尺度。

10、GeneGroove: iPhone/iPad


如果你看够了利用上述应用程序所进行的基因组序列详细生物学分析,你可以通过GeneGroove应用程序,随着音乐的韵律热动而变速并沉溺于你内心的音乐,利用23andMe基因组序列数据(无论是自己的,还是应用程序所提供的基因组样本),这种程序会产生一种音乐旋律。

(生物通:王英)

更多阅读:Nature子刊:新型强大的基因发现工具

http://www.biotechniques.com/news/Ten-Apps-for-Busy-Researchers-Sequence-AnalysisBioinformatics/biotechniques-353252.html

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