Life Tech推出新的转录组分析方案[新品推荐]

【字体: 时间:2014年09月12日 来源:生物通

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  Ion AmpliSeq转录组方案(Ion AmpliSeq Transcriptome Solution)能够从仅仅10 ng RNA中产生基因表达谱,并与FFPE样本兼容。这对于肿瘤和转化研究人员而言十分关键。目前的基因表达分析方法需要较多的起始材料,如芯片需要50 ng RNA,而转录组测序需要100 ng,也不一定能与FFPE样本兼容。

生物样本库(biobank)是融合生物样本实体、生物分子信息、样本表型数据以及样本研究信息的综合资源库,对于人类疾病的预测、诊断、临床治疗具有不可替代的重要作用。然而,由于组织样本的量有限,转化研究的人员往往无法从中获得整体的基因表达谱。为此,Life Technologies(赛默飞世尔旗下)基于Ion Proton系统,推出了Ion AmpliSeq转录组方案。

Ion AmpliSeq转录组方案(Ion AmpliSeq Transcriptome Solution)能够从仅仅10 ng RNA中产生基因表达谱,并与FFPE样本兼容。这对于肿瘤和转化研究人员而言十分关键。目前的基因表达分析方法需要较多的起始材料,如芯片需要50 ng RNA,而转录组测序需要100 ng,也不一定能与FFPE样本兼容。这一新方案还带来了一个更快速、更经济的流程,既不需要芯片的繁琐处理,也不需要转录组测序的复杂分析。

凭借Ion AmpliSeq技术的快速和简约,这种高度多重的PCR富集方法实现了快速的表达谱分析,而手工操作时间很少,可在2天内获得定量的基因表达数据。与传统的芯片分析相比,这种方法带来了更宽的动态范围和更好的转录本检测,实现了基因水平的转录组测序。

印第安纳大学医学院外科学习的基因组学主任Brad Hancock评价道:“Ion AmpliSeq转录组技术是一种非常有用的研究工具,适用于分析起始量低的FFPE样本的任何研究小组。过去,我们高度降解、产量低或显微切割的样本无法成功处理,如今有了可靠、高效的文库制备管道。”

一说到测序数据的分析,人们往往心中忐忑。然而,有了Ion Torrent Suite软件,只需按下几个按钮,即可生成差异表达谱。在初步分析之后,芯片和新一代测序用户还能够方便地将数据导出到现有的下游分析应用程序。每块PI芯片建议处理8个样品,不过也能根据需求,提高或降低通量。这样,研究人员就不必等待几个星期来凑够单次运行的样品。

赛默飞世尔基因科学研究的主管Chris Linthwaite表示:“阐明生物样本库中新数据的能力是转化研究领域的一个重要转折点。Ion AmpliSeq Transcriptome让研究人员能够开展前所未有的回顾性研究,这将为肿瘤及其他人类疾病中许多悬而未决的科学问题带来新的见解。”(生物通 薄荷)

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