Circulation Research:Arraystar LncRNA芯片研究循环性生物标记物

【字体: 时间:2015年01月08日 来源:康成生物

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  德国汉诺威医学院分子与转化治疗策略研究所的Thomas Thum博士课题组,主要从事心血管疾病和移植医学中基于非编码RNA治疗策略的研究。

  

德国汉诺威医学院分子与转化治疗策略研究所的Thomas Thum博士课题组,主要从事心血管疾病和移植医学中基于非编码RNA治疗策略的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的血浆lncRNA-LIPCAR,在早期心肌梗死(心梗)后左室重塑病人、晚期心梗后左室重塑病人、病情更严重的慢性心脏衰竭(心衰)病人中表达量逐步增高;以及生存期短的心衰病人较生存期长的病人,其LIPCAR的表达也显著增高。这些研究为心脏重塑预后及心衰病人的存活期预测提供了新的潜在生物标记物。该研究成果刊登在国际权威期刊Circulation Research(影响因子11.089)。(芯片实验由Arraystar提供技术服务

研究背景:
心血管疾病是致使人类死亡的主导原因。相较于在致病机制和治疗等方面取得的进步,其诊断手段仍旧匮乏。近期研究表明,不同病状的心衰通过lncRNA的表达谱可得以区分。然而,却未有用于心脏疾病诊断的血浆lncRNA的相关研究报道。Thomas Thum博士课题组本次研究目的是利用Arraystar Human LncRNA 芯片对血浆lncRNA作为预测心衰病人生存期的潜在生物标记物展开了系统研究。

研究思路:
为了系统检测心梗后左室重塑病人中lncRNA的表达变化,作者首先应用美国Arraystar Human LncRNA芯片检测了早期心梗后左室重塑病人和未重塑病人血浆中的lncRNA表达变化。借助于聚类分析和分子生物学手段,确认了血浆lncRNA-LIPCAR 在早期心梗后左室重塑病人中低表达,晚期时高表达。
作者进一步研究血浆lncRNA-LIPCAR在心衰病人中的表达水平,发现病情更严重的慢性心衰病人较晚期心梗后左室重塑病人,其LIPCAR的表达更高;生存期低于3年的心衰病人较生存期高于3年的病人,其LIPCAR表达量更高。

技术路线:


 

结果展示: 



 
A. 聚类图显示差异表达的lncRNA(左图),火山图显示差异表达的lncRNA(右图);
B. qPCR结果表明,生存期低于3年的心衰病人较生存期高于3年的病人,其LIPCAR表达量更高。

研究意义:
该研究揭示了血浆中的lncRNA的异常表达变化与心脏疾病病人的疾病程度相关联。在早期心梗后左室重塑病人中血浆lncRNA-LIPCAR低表达,晚期时高表达,而病情更严重的慢性心衰病人中的表达量则更高;生存期低于3年的心衰病人较生存期高于3年的病人,其LIPCAR表达量也更高。该研究对于揭示血浆lncRNA-LIPCAR在心脏疾病中行使的功能的研究提供了理论基础,为心脏重塑预后及心衰病人生存期的预测提供了潜在的生物标记物。

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原文出处:
Circulating Long Noncoding RNA, LIPCAR, Predicts Survival in Patients With Heart Failure. Circulation Research. 2014,114(10):1569-75.
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