刘淮教授Plos One利用Arraystar LncRNA芯片研究先兆子痫

【字体: 时间:2015年01月12日 来源:康成生物

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  江西省妇幼保健院刘淮教授长期从事高危妊娠,难产,妇科肿瘤,妇科炎症,妇科内分泌的诊治和基础研究。带领研究小组首次利用Arraystar Human LncRNA芯片研究子痫前期胎盘组织中全基因组lncRNAs表达模式。

  

江西省妇幼保健院刘淮教授长期从事高危妊娠,难产,妇科肿瘤,妇科炎症,妇科内分泌的诊治和基础研究。带领研究小组首次利用Arraystar Human LncRNA芯片研究子痫前期胎盘组织中全基因组lncRNAs表达模式。发现大量lncRNAs在子痫前期胎盘异常表达,并挑选3个lncRNA:LOC391533,LOC284100和CEACAMP8进行了深入数据分析和研究,表明lncRNAs可能在子痫前期发育中起到关键的作用。为先兆子痫的生物机制深入研究提供新的见解,并为今后治疗先兆子痫提供潜在靶标。该研究成果刊登在国际期刊Plos One(影响因子3.534)。(芯片实验由康成提供技术服务

研究背景:
先兆子痫是导致全球围产儿发病和死亡的主要因素。先兆子痫影响3-5%的孕妇,可能导致每年全球60,000例产妇死亡。到目前为止,治疗的唯一方法是引产。由于在葡萄胎妊娠患者中可以观察到先兆子痫,而胎儿实际并不存在,表明胎盘异常足以导致先兆子痫。长链非编码RNA(lncRNAs)是一类重要的调控RNA,参与多种生物学功能调控,在许多疾病中有异常表达。LncRNA是近5年来生物和医学界的热门研究领域,但是lncRNA在先兆子痫中的作用目前仍不清楚。本次研究目的是利用Arraystar Human LncRNA 芯片对lncRNA在先兆子痫胎盘中的lncRNA表达和功能展开系统研究。

研究思路:
为了系统的研究lncRNA在先兆子痫中的作用,研究者采用美国Arraystar Human LncRNA芯片,对6例子痫前期胎盘和5例正常妊娠胎盘的lncRNA表达进行分析。与正常胎盘相比,子痫前期胎盘中738个lncRNA表达有明显差异,差异倍数达到1.5倍以上。

借助于生物信息分析,基于差异表达lncRNAs和mRNAs的相关性,研究者构建了编码-非编码基因共表达网络(CNC网络)。结合对差异表达lncRNAs和mRNAs的CNC网络和针对基因的GO分析,挑选得到3个lncRNA进一步研究lncRNA与子痫前期的关系。这3个lncRNA是LOC391533, LOC284100和 CEACAMP8。

研究者采用qPCR方法,在40例子痫前期胎盘和40对照样本中检测这三个lncRNA的表达。结果显示,与正常对照相比,这3个lncRNA在子痫前期胎盘中存在异常表达。

技术路线:

结果展示: 

 
A. 芯片筛选得到的差异表达的lncRNA,上调(左),下调(右)
B. 编码基因和非编码基因共表达网络图(CNC network)

研究意义:
本研究是第一次利用Arraystar Human LncRNA芯片研究子痫前期胎盘组织中全基因组lncRNAs表达模式。结果揭示,与正常组相比,lncRNAs在子痫前期胎盘异常表达,表明lncRNAs可能在子痫前期发育中起到关键的作用。LOC391533,LOC284100和CEACAMP8失调可能参与了先兆子痫机制。本研究为治疗先兆子痫提供了潜在的lncRNA靶标以及对先兆子痫生物学机制的深入研究提供新的见解。

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原文出处:
LncRNAs Expression in Preeclampsia Placenta Reveals the Potential Role of LncRNAs Contributing to Preeclampsia Pathogenesis. PLoS ONE 8(11): e81437.
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