干细胞牛人Science:捕捉转录因子的非编码RNA

【字体: 时间:2015年11月30日 来源:生物通

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  转录因子通过结合启动子近端和远端的特异性序列,对基因转录进行调控。人们发现,RNA聚合酶除了读取基因编码区域,还会在这些位置生成RNA。不过对些RNA分子的功能一直是一个谜。Whitehead生物医学研究所的科学家们在Science杂志发表文章指出,调控元件转录的RNA有助于稳定转录因子和调控元件之间的互作。

  

生物通报道:生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。这样的基因表达受到转录因子的控制。

转录因子通过结合启动子近端和远端的特异性序列,对基因转录进行调控。人们发现,RNA聚合酶除了读取基因编码区域,还会在这些位置生成RNA。不过对些RNA分子的功能一直是一个谜。

Whitehead生物医学研究所的科学家们在Science杂志发表文章指出,调控元件转录的RNA有助于稳定转录因子和调控元件之间的互作。领导这项研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Young博士,Young是研究人类胚胎干细胞的先驱,也是著名的基因组研究专家,在利用组学工具研究干细胞方面做出了重要的贡献。

人类基因组中的蛋白编码基因只有不到2%,这些蛋白决定着生物的外形、行为和健康情况。不过,人们对其余98%的基因组还知之甚少。上世纪六十年代科学家们发现,一些非编码DNA控制着基因的开关和表达量,这些序列位于基因附近是转录因子的结合位点。(延伸阅读:Cell:转录因子决定肿瘤干细胞的命运

这项研究显示,这些与转录因子结合的调控位点也转录RNA,而且这些RNA能够与转录因子结合。研究人员推测,这些RNA可能涉及了转录因子与调控元件互作。

YY1Yin-Yang 1)是一种广泛表达的转录因子。研究表明,基因组中的YY1既能结合基因调控元件,也能结合这些元件生成的RNA。抑制调控元件的RNA转录,会减少YY1在这些位置的结合。人为引入RNA的束缚,可以增强YY1的结合。

研究指出,调控元件转录的RNA在基因表达中起到了重要的作用。这种转录形成了一个巩固转录因子结合的正反馈回路,有助于提高基因表达程序的稳定性。

 

生物通编辑:叶予

生物通推荐原文:Transcription factor trapping by RNA in gene regulatory elements

 

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