中国科学家Nature子刊再发GWAS研究新成果

　　

生物通报道  来自南京医科大学、清华大学、宁夏医科大学总医院等十多家机构的研究人员，通过全基因组关联研究（GWAS）鉴别出了非综合征性唇裂或唇腭裂(Nonsyndromic cleft lip with or without a cleft palate,NSCL/P)的一个新易感位点。这一研究成果发表在3月16日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。

南京医科大学的沈洪兵(Hongbing Shen)教授、王林（Lin Wang）教授以及宁夏医科大学总医院的杨银学（Yinxue Yang）教授是这篇论文的共同通讯作者。

先天性唇腭裂是人类最常见的先天性畸形之一，一般在危险因素致畸的作用下，发生在胚胎发育4～12周。唇腭裂患者不仅存在外形上的缺陷，其饮食、语言等功能也伴有不同程度的障碍，常常造成性格缺陷，影响正常的社会交往，降低生活质量，又因治疗程序复杂、周期漫长、花费大、给家庭和社会带来沉重负担，严重影响了出生人口素质，因此寻找该病的病因，进而找到有效地预防手段显得非常重要。

从遗传学上唇腭裂分为综合征性唇裂或唇腭裂、综合征性腭裂、非综合征性唇裂或唇腭裂（NSCL/P）和非综合征性腭裂（NSCP）。综合性唇腭裂一般因为染色体异常或单基因发生突变所致，病因比较明确。而非综合性唇腭裂的发病原因至今医学界仍无定论。NSCL/P的发病率为0.1-0.2%，其发病机制不明，病因复杂具有明显遗传异质性。研究结果发现，NSCL/P的发生是环境、遗传因素以及二者相互作用的结果，其中遗传因素起重要作用。

GWAS是一种对全基因组范围内的常见遗传变异（单核苷酸多态性和拷贝数）基因总体关联分析的方法，在全基因组范围内进行整体研究，能够一次性对疾病进行轮廓性概览，适用于复杂疾病的研究。在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，有可能全面揭示出疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因（延伸阅读：山东大学Nature Genetics发表GWAS研究新成果 ）。

在这篇文章中研究人员报告称，他们在进行了第一轮基于病例对照的GWAS研究后又进行了两轮的重复验证。他们利用来自中国的6个独立组群阐明了在中国人群中NSCL/P的遗传结构。通过这样的综合分析，研究人员鉴别出了一个定位在16p13.3与NSCL/P相关的新位点：位于CREBBP和ADCY9之间的rs8049367。他们还证实以往报道过的定位于1q32.2、10q25.3、17p13.1及20q12的位点也与中国人群NSCL/P形成有关。

研究结果进一步地提供了证据证实，定位在1q32.2的rs2235371相关单体型相比以往在中国人群中发现的因果变异rs642961发挥了更重要的作用。这些研究发现为我们提供了有关NSCL/P遗传基础和机制的一些重要信息。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Genome-wide association study identifies a new susceptibility locus for cleft lip with or without a cleft palate

Nonsyndromic cleft lip with or without a cleft palate (NSCL/P) is among the most common human congenital birth defects and imposes a substantial physical and financial burden on affected individuals. Here, we conduct a case–control-based GWAS followed by two rounds of replication; we include six independent cohorts from China to elucidate the genetic architecture of NSCL/P in Chinese populations. Using this combined analysis, we identify a new locus at 16p13.3 associated with NSCL/P: rs8049367 between CREBBP and ADCY9 (odds ratio=0.74, P=8.98 × 10−12). We confirm that the reported loci at 1q32.2, 10q25.3, 17p13.1 and 20q12 are also involved in NSCL/P development in Chinese populations. Our results provide additional evidence that the rs2235371-related haplotype at 1q32.2 could play a more important role than the previously identified causal variant rs642961 in Chinese populations. These findings provide information on the genetic basis and mechanisms of NSCL/P.