让NGS的文库制备一步到位[新品推荐]

【字体: 时间:2015年03月03日 来源:生物通

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  在第16届基因组生物学技术进展大会(AGBT)召开前夕,Illumina公司宣布推出NeoPrep文库制备系统。这是一款数字微流体平台,能够大大简化新一代测序(NGS)的文库制备,带来测序即用的高质量文库。

在第16届基因组生物学技术进展大会(AGBT)召开前夕,Illumina公司宣布推出NeoPrep文库制备系统。这是一款数字微流体平台,能够大大简化新一代测序(NGS)的文库制备,带来测序即用的高质量文库。

NeoPrep方案包括NeoPrep台式仪器、一次性的文库卡片(library card)和试剂。它单次运行即可制备、定量和均一化文库。数字微流体精确操控纳升大小的液滴,最终将剪切的DNA或RNA转变成测序即用的文库。这种革命性的技术实现了16个文库的平行制备,而手工操作只需30分钟。

如果你熟悉NGS的文库制备,那么你应该清楚,人们需要好好计划时间来安排洗涤和孵育的关键步骤。如今,通过内置的磁珠操作、热循环和光学检测组件,NeoPrep系统可自动完成文库制备,帮你节省数小时的时间,而你只需要按一按触摸屏。从NeoPrep系统收集到文库之后,经过简单的稀释、变性,即可上样到测序仪中。

NeoPrep的流程分为三个步骤:运行准备、文库卡片上样和运行结束时的文库收集。与手动的文库制备方法相比,这个简单的流程能将制备文库所需的移液工作减少85%,将手工操作时间降低90%,真正实现文库制备过程中的无人值守。对于那些希望提高样品通量、简化制备流程的实验室而言,NeoPrep系统可谓心水之选。

Illumina应用小组曾试过将NeoPrep、NextSeq与BaseSpace相结合,来完成一个标准的RNA-Seq应用:癌症样品的基因表达谱分析和融合检测。他们使用了8个癌症细胞系的总RNA(总共16个样品),在周一下班前上样到NeoPrep中。整个过程在11个小时内完成。事实上,在研究人员周二上班之前,文库制备的结果就已经发送到他的邮箱了。所有样品都达到最低产量的预期,并均一化到10 nM的浓度,可立即上样到Illumina测序仪中。

NeoPrep系统制备的文库可在Illumina所有测序系统上测序,包括MiSeq、NextSeq 500或HiSeq系统,并利用BaseSpace环境分析。NeoPrep系统以及TruSeq® Nano DNA Kit和TruSeq Stranded mRNA Kit的NeoPrep版本将在这个月开始发售。其他文库制备产品将在今年晚些时候上市,包括TruSeq DNA PCR-Free Kit及其他靶向重测序试剂盒的NeoPrep版本。(生物通 余亮)

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