三篇NEJM文章聚焦无创产前检测,假阳性值得注意

【字体: 时间:2015年04月03日 来源:生物通

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  近年来,利用无创产前检测(NIPT)来筛查胎儿的染色体非整倍体已广泛应用,并有望从高危孕妇扩展到一般风险的孕妇。4月1日在线发表于《新英格兰医学杂志》上的三项新的研究,阐明了NIPT筛查的表现和风险。

  

生物通报道 近年来,利用无创产前检测(NIPT)来筛查胎儿的染色体非整倍体已广泛应用,并有望从高危孕妇扩展到一般风险的孕妇。4月1日在线发表于《新英格兰医学杂志》上的三项新的研究,阐明了NIPT筛查的表现和风险。

根据贝勒医学院和香港中文大学的一项研究,NIPT假阳性结果的风险相当可观,如果孕妇不进行诊断确认,很可能导致不可逆转的妊娠终止。研究人员警告说,尽管新检测有着高的敏感性和特异性,但只能用于筛查,而不能替代确认性的染色体核型分析。

另一项由华盛顿大学团队领导的研究,深入分析了NIPT可能产生假阳性结果的原因之一,那就是母亲基因组中存在拷贝数变异。

尽管它有这些缺点,但根据一项大型临床研究的结果,NIPT在21三体的检测上还是优于传统的孕早期检测。这项研究由加州大学旧金山分校领导,涉及到16,000名女性。

为了研究各种无创产前检测的表现,贝勒和香港的研究人员重点研究了307名妇女,她们获得了阳性的NIPT结果,包括21三体、18三体、13三体、X单体、XXX、XXY或XYY,并转诊到侵入性的诊断检测。这些结果来自Sequenom的MaterniT21和SafeT21,BGI的NIFTY、Illumina的Verifi、Natera的Panorama以及Ariosa的Harmony。

对于13个病例,羊膜穿刺或绒毛膜取样后的核型分析表明嵌合的存在。而对于剩下294个NIPT阳性病例,19%(56个)被证明是假阳性的。其中,对于最常检测到的21三体,假阳性率在9%,XXX、XXY或XYY为17%,18三体为23%,13三体为46%,而X单体高达62%。

尽管染色体核型分析的结果也有可能是不准确的,但研究人员并没有被告知,婴儿在出生后有任何异常。香港中文大学的研究人员注意到,至少有8例假阳性的NIPT结果(大部分是21三体),但最终生下了健康的婴儿。

NIPT目前都是分析母体血液中的无细胞循环DNA,但它们的分析方法不同。NIPT产生假阳性结果,可能有几个原因,包括母体的体细胞嵌合、胎盘嵌合、双胞胎消失、母亲的癌症未被检测到,以及母亲的拷贝数变异。

华盛顿大学的研究人员深入探究了最后一个原因。在这一项研究中,他们分析了四名妇女的血液样本。这些妇女接受了Illumina的Verifi检测,并获得了阳性结果,其中有三名是18三体阳性,另一名是13三体阳性,但是最终诞下了健康的婴儿。

对于两名NIPT检测结果为18三体阳性的患者,他们在18号染色体上鉴定出重复的区域。研究人员推测,这些重复可能干扰了分析,因为18号染色体的测序读取比其他染色体多。

血液中大部分的无细胞DNA都来自母亲,而母体的重复使得读取数量增加,提高了假阳性的机会,而染色体缺失则减少了读取数量,提高了假阴性结果的概率。

这个影响究竟有多大,取决于无细胞DNA中胎儿的比例,重复或缺失的大小,以及它是否遗传给胎儿。有一名患者的18号染色体上有一段长达1.5 Mb的重复,并遗传给了胎儿,故假阳性结果的概率高了16,000倍。

基于拷贝数变异在一般人群中的频率,研究人员估计它们明显提高了NIPT获得假阳性结果的风险。不过,若是考虑母体的拷贝数变异,风险可降低。例如,一旦检测到这样的变异,则这一区域的读取至少应被部分丢弃,或根据需要增加或减少染色体的有效大小。

与贝勒和香港的研究一样,作者认为,尽管与传统的孕早期筛查相比,NIPT表现良好,但后续的诊断检测仍然很关键。“假阳性筛查结果的影响不仅仅是临床风险和经济成本,还给患者带来了巨大的心理压力,”他们写道。

尽管NIPT的实施仍然需要谨慎,但大型的临床研究证明,对于高风险和低风险的妊娠,它优于传统的孕早期21三体筛查。这项研究由加州大学旧金山分校、哥伦比亚大学和Ariosa的研究人员参与,其结果已在去年的ACMG年会上展示,但现在才正式发表。

不过,研究人员也表示,虽然这些结果支持NIPT在各类妇女上的使用,但还需要进一步的成本效用分析。在上周举行的ACMG年会上,Ariosa的CEO Ken Song就算了一笔账。

在美国,每年大约有400万名婴儿出生。假设筛查率在70%,Song计算出,标准的孕早期筛查(FTS)将检测出7800例21、18或13三体,而NIPT将检测出近9000例。由于假阳性率较高,FTS将导致1400例大多不必要的侵入性检查,而NIPT则少于100例。

Song认为,如果NIPT定价在453美元或以下,那么它将节省每个三体病例的总体成本。这个计算假定FTS为171美元,侵入性诊断检测为1300美元,拜访医生需要120美元,以及妊娠终止和患病儿童出生的各种费用。

英国伦敦大学学院儿童健康研究所的Lyn Chitty认为,NIPT的采用将最终“取决于当地的文化和社会因素,包括对残疾的态度、终止妊娠的法律,以及现有的医疗结构”,如现行的筛查项目。(生物通 薄荷)

原文检索

Accurate Description of DNA-Based Noninvasive Prenatal Screening

Copy-Number Variation and False Positive Prenatal Aneuploidy Screening Results

Cell-free DNA Analysis for Noninvasive Examination of Trisomy

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