Oxford Nanopore这次又发布了什么?

【字体: 时间:2015年05月18日 来源:生物通

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  近日,Oxford Nanopore公司在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了一些新产品。其中,最受期待的还是首席技术官Clive Brown的报告。当然,他也没让大家失望。与会者称这次发布会是“改变游戏规则的”,形容当时的气氛就像2007年苹果发布iPhone一样。这会不会有些夸张?让我们来看这次会议的一些亮点。

生物通报道 近日,Oxford Nanopore公司在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了一些新产品。其中,最受期待的还是首席技术官Clive Brown的报告。当然,他也没让大家失望。与会者称这次发布会是“改变游戏规则的”,形容当时的气氛就像2007年苹果发布iPhone一样。这会不会有些夸张?让我们来看这次会议的一些亮点。

Clive Brown称,他们的目标是将样品制备缩短到10分钟。为了实现这一点,Oxford推出了Voltrax,一个完全整合的自动化样品制备系统。这个不足手掌大小的设备是便携的,可编程的,且一次性的,有6-12个样品输入口。Brown表示这个产品将在今年晚些时候推出,能实现10分钟的样品制备。与会者认为现场测序真的来了。

据介绍,这个设备能将原始的生物样品转化成立即可测序的形式,且无需人工干预。它能够与MinION或PromethION测序仪直接对接。目前,MinION试用计划采用传统的文库制备试剂盒,需要用到提取好的DNA。

此外,Oxford Nanopore也推出了新的测序芯片。ASIC(特殊应用集成电路)是PromethION和MinION测序仪的核心。目前的ASIC芯片有512个通道,而新的芯片将有3000个通道。结构也将改变,ASIC将作为一种单独的耗材。

去年底,Oxford Nanopore在ASHG年会上发布了新产品PromethION。这是一款灵活的测序仪。它的模块化设计让用户能够根据需要,灵活调整通量和样品数量。流程也相当简单,特有实时的数据分析,因此无固定的运行时间,在到达预设的实验终点后即可停止。

这一次,Brown详细介绍了PromethION的一些参数。它是一款高通量的设备,采用新的ASIC芯片,最多包含48个流动槽单元,适合1-192个样品。每块芯片可处理4个样品,且芯片上有3000个通道,因此总共有144,000个通道。Voltrax设备可叠放在PromethION的上方。

据Brown介绍,快速模式很受欢迎。每块芯片的产量有望提高10倍,而两个月后这个数字可能提高到17倍。在正常模式下,每秒可读取30个碱基;而在快速模式下,每秒读取500个碱基。Brown表示,酶的加速实际上提高了读取质量,改善了一些短暂事件的检测。他还表示,快速模式让MinION的通量和成本与HiSeq相当。对于PromethION,用户每天可生成6.4 Tb。(生物通 余亮)

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