Cell技术专刊:把前浪拍死在沙滩上的那些新技术

【字体: 时间:2015年05月25日 来源:生物通

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  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。

  生物通报道:还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。

虽然许多传统的分子生物学技术仍然很有用,但是新技术提升了研究的速度,也扩展了许多可能性。以 DNA测序技术为例,首张人类基因组图谱花费了经年累月的时间,和上百万的费用,而现在利用最新的仪器,你可以在一年之内完成同样一份基因组测序,大约只需要两千美元,这无疑在基础研究和未来医学应用上都具有重要的意义。

最新一期Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术的发展,以及这些技术对研究和临床医疗的影响。一整期的内容都在描述功能强大的新兴工具技术,回望我们已经走过的路,以及未来即将要踏上的征程。

在开篇的社论中,编辑John W. Pham指出希望这一内容能为大家提供实用信息,读者们能在各自的科研中运用到这些新技术,因此专刊标题也十分简单,就是“Technology”。

Toward Whole-Transcriptome Editing with CRISPR-Cas9

基因表达靶向调控为生物医学研究开辟了一篇新天地,近期的几项研究都提出基于CRISPR Cas9 技术的复杂多元转录激活因子系统,以及全基因组文库都促进了转录研究领域。

比如去年加州大学的科学家们开发了一种CRISPR支架RNA(scRNA)。scRNA编码了靶位点和调控功能,能同时实现对不同基因的激活和抑制。

这种支架RNA可以用来设计多基因转录程序,在激活一些基因的同时抑制另一些基因。研究人员用这种方法,成功在酵母中重新定向了一个复杂的代谢通路。研究显示,scRNA在哺乳动物和酵母细胞中均能有效发挥功能。此外,诱导dCas9蛋白的表达可以控制转录程序的执行,成为整个体系的一个主要控制点。

这项研究为设计基因表达程序的研究者们提供了一个有力工具,该技术有着非常广泛的应用,比如改写细胞命运或者设计代谢通路。多基因的组合性控制可以帮助人们灵活操纵细胞中的通路。

Single-Cell Transcriptomics Enters the Age of Mass Production

今年Cell杂志发表了两项单细胞转录组的重要新成果,其中涉及的高通量单细胞转录研究方法:液滴微流体和先进的条码技术在个体细胞转录研究方面具有重要意义。

Collateral DNA Damage Produced by Genome-Editing Drones: Exception or Rule?

近期Nature Biotechnology发表了一项最新研究成果:研究人员研发了一种能捕获转位元件的重要技术,这种方法能用于确定基因组编辑过程中内切酶的脱靶区域,并且也能用于发现核酸内源插件。

十一项具体内容:

 《细胞》十一篇文章介绍前沿技术(一)

 十一篇文章介绍Chic技术(二)

原文摘选:

Technology: Fast Forward

Remember when there was no CRISPR-Cas9 genome editing? No atomic resolution cryo-EM? Remember when high-throughput sequencing didn’t exist? You don’t have to think back very far, because it wasn’t that long ago. In the past few years, the pace of technological progress has been incredible.
 

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