
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
华大基因购入首台单分子测序仪PacBio RS II
【字体: 大 中 小 】 时间:2015年05月05日 来源:生物通
编辑推荐:
美国Pacific Biosciences公司在5月4日宣布,全球最大的基因组学研发机构华大基因(BGI)已经购入了第一台单分子测序仪PacBio RS II,并计划购入更多台仪器,以便将单分子实时(SMRT)测序整合到其全球的服务体系中。美国Pacific Biosciences公司在国内由基因有限公司代理。
生物通报道 美国Pacific Biosciences公司在5月4日宣布,全球最大的基因组学研发机构华大基因(BGI)已经购入了第一台单分子测序仪PacBio RS II,并计划购入更多台仪器,以便将单分子实时(SMRT)测序整合到其全球的服务体系中。
PacBio RS II系统的读长为业内最长,能够达到深度覆盖且精确度高。利用最新的试剂,PacBio RS II的平均读取长度可达10 kb-15 kb,且每个SMRT cell能产生500 Mb-1 Gb的数据。在准确度方面,SMRT DNA测序可以实现超过99.999%(QV50)的高度精确测序,且不受DNA序列中GC和AT含量的影响。【延伸阅读:如何理解PacBio的准确度?】
这些特点让用户可以获得完整的序列变异类型,检测单核苷酸多态性和复杂的结构变异,以及此前无法检测到的基因组区域。此外,SMRT测序技术也是目前唯一一个可以跨越完整基因序列和染色体单倍体型直接检测碱基修饰和鉴定变异信息的技术。
华大基因CEO王俊博士表示,SMRT测序技术有着出色的读长和组装精度,将支持BGI提供的de novo基因组服务。PacBio是对具有高重复或杂合等复杂基因组测序的理想平台。有了单分子测序仪PacBio RS II,我们希望能实现向用户交付完整基因组的目标,提供最佳的动植物和人类参考基因组。
Pacific Biosciences的CEO Michael Hunkapiller评论道,全球领先及最大的测序机构华大基因采用了PacBio测序系统,是对我们技术的证明。华大基因也是测序数据分析的领导者,我们很高兴能携手华大基因,希望共同开发出更多的工具,实现数据的全部价值。
今年年初,PacBio的首席科学官Jonas Korlach公布了2015年的技术路线,计划将其测序通量提高4倍,使每个SMRT cell的产量超过4 Gb,平均读取长度增加到15-20 kb。此外,PacBio还计划提升样本制备流程并将其简单化,增加样品制备操作手册及多个数据分析的应用程序。
PacBio RS测序仪曾被生物通读者评为2010和2014年度的生命科学创新产品。Pacific Biosciences的产品在国内由基因有限公司代理。(生物通 余亮)
延伸阅读: