Cell：癌症基因组计划再取重要成果

　　

生物通报道  来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员称，他们将最致命的皮肤癌类型——黑色素瘤分为了4个不同的基因亚型，这一研究发现有可能会在寻求个体化医疗领域体现它的价值。这项研究是癌症基因组图谱计划（TCGA）的一个组成部分，研究人员将他们的成果发布在6月18日的《细胞》（Cell）杂志上。

研究人员通过分析从331名患者处获得的样本，根据突变情况定义了4个黑色素瘤亚型：BRAF、RAS、NF1和Triple-WT。这项研究工作是由来自5个国家的300多名研究人员通过国际协作付诸5年的时间完成。

外科、外科肿瘤学教授Jeffrey E. Gershenwald博士说：“开发出了一些有效的靶向疗法是临床处理晚期黑色素瘤患者取得的一项重大成就。通过这一黑色素瘤综合分类法我们构建出了一个框架，可将之用于靶向和免疫治疗领域中进一步个体化治疗决策，及开发出更有效的预后及预测模型来指导如何护理患者。”

在这篇文章中，科学家们发现所有4个基因亚型都共享了一些相同的“下游”信号通路，但它们激活这些信号通路的方式却有所不同。了解黑色素瘤的基因组基础或许可为现有的疗法提供一些其他的信息。

Watson 说：“例如，可联合使用BRAF和MEK抑制剂来治疗罹患BRAF突变黑色素瘤的患者，并且我们正在探索将一些MEK抑制剂组合用于RAS突变黑色素瘤。一些临床前研究已证实，某些NF1黑色素瘤细胞系会对MEK抑制剂产生反应，但仍需要开展更多的工作确定在这一新的黑色素瘤亚型中对药物有反应和无反应者，以及确定一些针对Triple-WT黑色素瘤患者的治疗策略。”

有趣的是，他们发现基因亚型与患者的结局之间无显著关联。但在每个基因亚型中他们发现了一个有免疫浸润迹象的亚类确实与生存率提高有关联。

了解Promega基因组DNA纯化试剂盒的详细资料

德克萨斯大学MD安德森癌症中心基因组医学前教授Lynda Chin说：“详细的分析结果表明，这些淋巴细胞并不仅是‘旁观者’。它们浸润到肿瘤中，有可能与黑色素瘤生物学相关。”这项研究还揭示了一种叫做LCK的T细胞生物标记物的重要性，LCK是一种存在于淋巴细胞或白细胞中的蛋白质。研究证实这一生物标记物与患者生存率改善有关联。

该研究团队预测，这一信息有可能会在新兴的免疫疗法领域发挥作用。在晚期黑色素瘤患者的治疗中免疫疗法已取得了一些成功（延伸阅读：里程碑成果：人类癌症病毒免疫治疗首次大获成功 ）。尤其是，近期获得批准的一些检查点阻断药物在黑色素瘤的治疗中显示出了令人难以置信的潜力。但目前尚不完全清楚哪些患者会对这种治疗产生反应。

Chin 说：“我们相信由来自全球的50家研究机构和20多个组织资源机构开展的这一国际协作，所生成的数据集将会成为一个宝库，并将为未来多年的研究播下种子。”

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Genomic Classification of Cutaneous Melanoma

We describe the landscape of genomic alterations in cutaneous melanomas through DNA, RNA, and protein-based analysis of 333 primary and/or metastatic melanomas from 331 patients. We establish a framework for genomic classification into one of four subtypes based on the pattern of the most prevalent significantly mutated genes: mutant BRAF, mutant RAS, mutant NF1, and Triple-WT (wild-type). Integrative analysis reveals enrichment of KIT mutations and focal amplifications and complex structural rearrangements as a feature of the Triple-WT subtype. We found no significant outcome correlation with genomic classification, but samples assigned a transcriptomic subclass enriched for immune gene expression associated with lymphocyte infiltrate on pathology review and high LCK protein expression, a T cell marker, were associated with improved patient survival. This clinicopathological and multi-dimensional analysis suggests that the prognosis of melanoma patients with regional metastases is influenced by tumor stroma immunobiology, offering insights to further personalize therapeutic decision-making.