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金标准的miRNA检测如今又升级[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2015年06月23日 来源:生物通
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TaqMan Assay一直被认为是荧光定量PCR分析的金标准,而qPCR分析又被认为是miRNA检测的金标准。当金标准遇上金标准,那自然是“你值得拥有”。如今,TaqMan MicroRNA Assay家族又添一新成员。赛默飞世尔科技推出了高级版的miRNA分析——TaqMan Advanced miRNA Assay。
TaqMan Assay一直被认为是荧光定量PCR分析的金标准,而qPCR分析又被认为是miRNA检测的金标准。当金标准遇上金标准,那自然是“你值得拥有”。如今,TaqMan MicroRNA Assay家族又添一新成员。赛默飞世尔科技推出了高级版的miRNA分析——TaqMan Advanced miRNA Assay。
TaqMan Advanced miRNA Assay包含预先配好的引物和探针组合,可检测和定量生物样本(主要是人类)中的成熟miRNA。配合新的TaqMan Advanced miRNA cDNA Synthesis Kit使用,此系统可同时分析单个样本中的多个miRNA靶标,并具有出色的灵敏度和特异性。
整个检测流程也大大简化。样本制备好之后,在miRNA的3’端加上poly(A)尾巴,而5’端连接一个接头序列,开展逆转录。接着,利用通用的引物和预混液对cDNA进行预扩增,均匀地增加每个靶标的cDNA量,维持相对的差异表达水平。之后就是利用qPCR来定量每个miRNA靶标。这样看来,只需一次RT反应,就能分析多个miRNA。
这个系统的优势之一就在于出色的灵敏度,适用于RNA量有限的血清和血浆样本。与传统的预扩增不同,此次采用的miR-Amp引物能识别添加在每个miRNA 5’和3’端的通用序列,从而避免扩增偏向。据介绍,TaqMan Advanced miRNA Assay能准确检测1 pg总RNA或2 µL血清/血浆中低至60个拷贝。
大家都知道,有些亲缘关系接近的mIRNA仅相差一个碱基,因此检测工具必须能区分这些高度相似的靶标。研究已经证明,TaqMan Advanced miRNA Assay能够区分let-7 miRNA家族成员,且几乎没有交叉反应性。对于miRNA 5’端高度保守的种子区域,此分析表现出卓越的特异性,即使相差一个碱基,也能很好区分。
此外,TaqMan Advanced miRNA Assay也延续了TaqMan Assay极佳的重复性和宽的动态范围。据介绍,此分析能检测6-log动态范围内的miRNA靶标,而重复性的改善也有利于少量miRNA靶标的检测。
目前,经典的TaqMan MicroRNA Assay仍在出售。这两者有何不同?请看下表。
|
TaqMan MicroRNA Assay |
TaqMan Advanced miRNA Assay |
描述 |
在cDNA合成过程中采用靶标特异的茎环引物,产生qPCR的模板 |
采用通用的逆转录步骤和通用的miR-Amp步骤,实现高度灵敏的检测 |
逆转录 |
miRNA特异的RT |
通用的RT |
通量 |
适合1-10个靶标 |
适合 >10个靶标 |
覆盖 |
205个物种 |
关注人类miRNA |
形式 |
单管、TaqMan array卡片和板、OpenArray的形式 |
单管;其他请咨询 |
(生物通 余亮)