赛默飞世尔重磅推出两款测序仪[新品推荐]

【字体: 时间:2015年09月03日 来源:生物通

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  开学伊始,赛默飞世尔就发布重磅消息,即将推出两款新一代测序(NGS)系统。这也是赛默飞世尔收购Life Technologies以来,首次扩展测序产品线。新的Ion S5和Ion S5 XL将组成Ion Torrent的中端产品线,其价格和通量介于Ion PGM和Ion Proton之间。

开学伊始,赛默飞世尔就发布重磅消息,即将推出两款新一代测序(NGS)系统。这也是赛默飞世尔收购Life Technologies以来,首次扩展测序产品线。新的Ion S5和Ion S5 XL将组成Ion Torrent的中端产品线,其价格和通量介于Ion PGM和Ion Proton之间。

Ion Torrent测序仪是基于一种独特的技术。它采用大规模并行的半导体芯片,对DNA复制期间产生的氢离子进行实时测定。与其他NGS平台相比,它不需要激光、照相机或标记,价格当然要便宜很多。设计时的最初构想是读取大量的DNA片段,进而扩展到人类基因组。如今,这两款新仪器填补了赛默飞世尔产品目录中的空白。

另一方面,Ion PGM和Ion Proton的用户都倾向于使用这种技术来进行靶向测序。此平台也被西奈山基因组学实验室等大机构所采用,以分析各种与疾病相关的变异。赛默飞世尔曾表示,靶向重测序是他们特别成功的领域,特别是在肿瘤学方面。因此,他们会将重点放在这一方面,并提供能真正改善流程的产品。

Ion S5和Ion S5 XL系统的发布也印证了这一说法。新的仪器特有三款新的Ion芯片:Ion 520、530和540芯片,能够在2.5小时内产生5M至80M测序读取。它们也采用即插即用的试剂,简化了测序仪的设置和操作。随着手动操作时间减少以及流程简化,这两款仪器让更多的科研、转化和临床研究实验室能够采用靶向测序。

据介绍,在使用Ion Chef系统进行自动化的文库构建、模板制备和芯片上样时,每次测序运行的手动设置时间仅需15分钟,而整个流程的手动时间不到45分钟。S5和S5 XL型号之间的主要区别在于计算能力。Ion S5系统适合对周转时间没有限制的科研或转化实验室,而Ion S5 XL适合需要更快周转或更高通量的临床研究实验室。

MD Anderson癌症中心的Meenakshi Mehrotra博士和Dzifa Yawa Duose博士比较了Ion S5 XL系统以及Ion PGM和Proton系统。Duose博士表示,Ion S5 XL系统将运行时间从4.5小时缩短到2.5小时,并将数据分析的时间减少了一半。“我们在相同的芯片上运行不同的集合,获得的变异与之前的PGM和Proton平台100%一致。”

Ion Torrent总经理Mark Gardner在介绍新产品的公开信中表示:“我们相信,Ion S5系统带来了台式测序仪的最大价值。我们在设计Ion S5系统时考虑了易用的流程,同时保留了最大的应用灵活性,这使得Ion S5系统成为合作伙伴开发他们自己分析时的首选平台。”

至于新的测序仪为什么要叫S5,Gardner也在信中给出了答案。很简单,因为新仪器运行500系列芯片,之前PGM运行300系列,Proton运行400系列,因此5代表了芯片。而S则代表了很多东西,包括速度(speed)、简约(simplicity)和扩展(scalability)。当然,它也代表测序(sequencing)。(生物通 余亮)

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