RNA编辑如何促进肿瘤生长？

　　

生物通报道：最近一项新的研究，对于RNA（核糖核酸）编辑在癌症中可能发挥的作用，提供了新的见解。这项研究结果发表在《Scientific Reports》杂志，可以让我们进一步了解参与肿瘤发生和发展的一种新机制，并因此可能在未来带来更好的治疗方案。

在每一个健康的人体细胞中，连接到DNA中的遗传信息，被转录成信使RNA，进而翻译成蛋白质——身体所有组织和器官的重要组成。流行的观点认为，大多数恶性肿瘤都是由DNA突变引起的，它可导致相应蛋白产物的异常活化或失活，从而导致恶性细胞的生长和增殖失控。RNA编辑——通过这个过程RNA序列的“突变”在转录后被引入，有可能影响各种各样的细胞过程，但是，确切机制至今尚不明确。

以前的研究表明，基因组中有超过一百万个位点在不同程度上被编辑。尽管，大多数的这些编辑位点属于不翻译为蛋白质的区域，但是据证明，RNA编辑水平在肿瘤和正常组织之间的差异，与不同的临床预后结果有关。目前，只有少数的编码RNA编辑位点功能已经得以表征。然而，非编码区中的大多数RNA编辑事情是否以及如何影响肿瘤的生长，仍然是一个谜。

在这项研究中，来自波士顿大学医学院（BUSM）的研究人员，分析了14个类型的肿瘤，并确定了超过2000个基因，它们的RNA编辑水平在肿瘤组织和正常组织之间表现出显著的变化。

联川生物为研究人员提供从非编码RNA发现到表达谱分析的一站式解决方案

本文通讯作者、BUSM医学副教授Stefano Monti解释说：“这项研究表明，RNA编辑可以作为细胞调控的一种重要的表观遗传学机制，超越了遗传学/DNA水平。我们表明，一个表观遗传成分的影响，可以被另一个表观遗传成分的变化所抵消。因此，对癌症基因组学的变化有一个全面的了解，是很重要的，这可能发现适合靶向治疗的漏洞。”

去年11月份，曹雪涛院士在《Cell Research》杂志上发表了一篇题为“RNA editing by ADAR1 marks dsRNA as ‘self’”的文章，为我们亮点推荐了近期发布在《科学》（Science）杂志上的一项新研究成果。在这篇文章中，澳大利亚St. Vincen医学研究所的Carl R. Walkley领导的研究小组证实由ADAR1介导的RNA编辑将内源性双链RNA（dsRNA）标记为是“自我的”的分子（曹雪涛院士亮点推荐Science文章：重要的RNA编辑）。今年3月份，浙江大学生命科学学院章晓波教授领衔的课题组，通过对日本囊对虾（Marsupenaeus japonicusshrimp）感染白斑综合症病毒（WSSV）的Ago复合物的序列进行测序分析，揭示出宿主ADAR（RNA依赖性腺苷脱氨酶）催化A-to-I RNA编辑病毒miRNA（WSSV-miR-N12）+16位点（浙大：RNA编辑阻止RISC识别靶标mRNA）。

（生物通：王英）

生物通推荐原文摘要：
Altered RNA editing in 3' UTR perturbs microRNA-mediated regulation of oncogenes and tumor-suppressors
Abstract：RNA editing is a molecular event that alters specific nucleotides in RNA post-transcriptionally. RNA editing has the potential to impact a variety of cellular processes and is implicated in diseases such as cancer. Yet, the precise mechanisms by which RNA editing controls cellular processes are poorly understood. Here, we characterize sequences altered by RNA editing in patient samples from lymphoma, neuroblastoma and head and neck cancers. We show that A-to-I RNA editing sites are highly conserved across samples of the same tissue type and that most editing sites identified in tumors are also detectable in normal tissues. Next, we identify the significant changes in editing levels of known sites between tumor and paired "normal" tissues across 14 cancer types (627 pairs) from The Cancer Genome Atlas project and show that the complexity of RNA editing regulation cannot be captured by the activity of ADAR family genes alone. Our pan-cancer analysis confirms previous results on individual tumor types and suggests that changes of RNA editing levels in coding and 3'UTR regions could be a general mechanism to promote tumor growth. We also propose a model explaining how altered RNA editing levels affect microRNA-mediated post-transcriptional regulation of oncogenes and tumor-suppressors.