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J Pathol:应用Exiqon microRNA芯片研究结直肠癌
【字体: 大 中 小 】 时间:2016年03月22日 来源:康成生物
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中国解放军总医院(301医院)韩卫东教授和第二军医大学孙树汉教授合作指导研究小组,采用microRNA芯片对MSI型CRC进行了系统全面的microRNA组研究,并阐释microRNA在MSI型CRC中的分子病理作用。
中国解放军总医院(301医院)韩卫东教授和第二军医大学孙树汉教授合作指导研究小组,采用microRNA芯片对MSI型CRC进行了系统全面的microRNA组研究,并阐释microRNA在MSI型CRC中的分子病理作用。通过比较MSI型和MSS型的样本,在芯片筛选和PCR验证实验后发现8个microRNA可用于区分CRC的MSI亚型。其中,miR-484下调最显著。而miR-484的表达下调主要受CpG岛甲基化调控。通过体外和体内实验发现,miR-484作为肿瘤抑制分子抑制MSI型CRC细胞的生存活力。进一步研究表明,miR-484通过抑制靶基因CD137L减少MSI型CRC细胞的IL-8量。该研究成果于2015年发表在J Pathol上(影响因子7.33)。(芯片实验由康成生物提供技术服务)
研究背景
结肠直肠癌(CRC)是最常见的癌症之一,在全球癌症相关死亡原因中排第四。带有MSI(微卫星不稳定性)的结肠直肠癌(CRC)亚型定义明确,约占CRC的15%,其特征包括错配修复信号通路缺陷和典型临床病理特征。MSI型CRC有一定异质性,包括散发性CRC和遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC,Lynch综合征)两大类。这两类虽然都存在有缺陷的错配修复(MMR)信号通路,但临床病理表现差别大。而淋巴细胞浸润和致癌加速是HNPCC和散发型 MSI型CRC的共同特征。
技术路线
结果展示
图释:左图:芯片结果的聚类分析;右图:MSI型标记物的8个microRNAs对MSS亚型和MSI亚型组织样本的聚类结果。
图释:miR-484的启动子区CpG岛分析和甲基化程度检测
(A) 采用在线工具MethPrimer analysis 找到miRNA-484上游3 kb左右存在CpG岛;
(B, C) 采用MSP方法研究7个人CRC细胞系的miR-484启动子甲基化 (B)无处理;(C)5-aza处理。
图释:在多种CRC细胞中,分别敲除或过表达miR-484,结果发现miR-484能促进细胞凋亡,抑制细胞增殖,说明miR-484具有抑癌功能。
图释:miR-484靶基因预测和报告基因实验验证
研究意义
该项研究结果有助于更好地理解microRNA在特征型的MSI型CRC中的作用,并为未来针对这一类病人的早期诊断和基因治疗开发提供了基础。
原文出处
Qian M.,et al., Methylation-induced loss of miR-484 in microsatellite-unstable colorectal cancer promotes both viability and IL-8 production via CD137L. J Pathol 2015; 236: 165–174