Cell重大成果：人类全蛋白质组检测技术汇编(免费)

　　

生物通报道  美国系统生物学研究所(ISB)的资深研究员Ulrike Kusebauch博士在7月28日的《细胞》（Cell）杂志上发表研究报告，描述了与ISB、苏黎世联邦理工学院及其他一些研究机构的科学家们合作开发出人类SRMAtlas的成果。

人类SRMAtlas是靶向识别及可重复性定量预测人类蛋白质组中所有蛋白的一些高度特异性质谱测定法的一个汇编目录，包括针对许多剪接变异体、非同义突变和翻译后修饰的检测方法。研究人员采用称作为选择性反应监测的技术，利用166,174个已充分确定特征的化学合成水解肽段（roteotypic peptides）开发出了这些检测方法。

这一SRMAtlas资源在http://www.srmatlas.org免费公开提供，将让一些重点、假设驱动及大型蛋白质组规模的研究获益。由于在理论上现在可以鉴别和定量任何样本中所有的蛋白质，研究人员预计这一资源将会大大推动基于蛋白质的实验生物学来了解疾病转变和健康轨迹。

联川生物为研究人员提供一站式蛋白质组定量分析方案

能够可靠、可重复性地检测任何组织或细胞类型中人类蛋白质组的所有蛋白，对于了解系统层次的特性和生理及疾病中一些特异的信号通路具有革命性意义。在美国系统生物学研究所Robert Moritz的实验室中，借助称作为选择性反应监测（SRM）的方法，一个合作项目生成并验证了一些高度特异性靶向蛋白质组检测法的一个汇编目录，通过这一可广泛获取的、敏感及强大的靶向质谱方法SRM，现在能够量化20,277个注释人类蛋白质中99.7%的蛋白。这一人类SRMAtlas为确凿地鉴别生物样本中单独的肽段提供了明确的检测坐标。

尽管2003年科学家们完成了人类基因组计划，构建出了人类所有基因的目录，大多数的蛋白质研究仍然将焦点放在绘制人类基因组前探索的相当小部分的蛋白质上。为了超越这种停滞的蛋白质基因组研究方法，需要开发出针对几乎所有人类蛋白质的高度特异性的检测方法。利用诸如人类SRMAtlas一类的资源。测量所有蛋白质的展望现在变成了现实。现在人类SRMAtlas提供了基于在一个统一、一致过程中开发的SRM技术，针对人类蛋白质组几乎所有蛋白的已经验证的MS检测法。这些检测方法可迅速用于系统生物学和生物医学研究中，以高度的敏感性和选择性鉴别及定量所有人类蛋白，导航全蛋白质图谱来了解它们的生物学功能。

个体化医学将依赖于分子标记来检测健康状态，提供鉴别健康轨迹中一些改变的信号，提供一开始在临床试验，随后在临床实践中让合适的患者匹配正确药物的信息。这一人类SRMAtlas计划稳固地将蛋白质组学推到前沿，为蛋白质组学在全球广泛的癌症登月计划(Cancer Moonshot)发挥大作用提供了更多的弹药。

通过在小鼠身上开展大规模的蛋白质组研究，科学家们获得了有关脂肪和能量代谢紊乱分子背景的新知识。由苏黎世联邦理工学院Ruedi Aebersold教授领导的一个专攻蛋白质组学的研究小组，与瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）Johan Auwerx教授领导的专门研究线粒体生理学和肝脏疾病的课题组共同合作完成了这一开创性的研究项目。他们的研究论文发布在2016年6月9日的Science杂志上（Science发布大规模蛋白质组研究重大成果 ）。

对于血浆样品的质谱分析，一个重大挑战是高丰度蛋白往往占据了主要信号，而掩盖了人们感兴趣的低丰度蛋白的信号，比如疾病的生物标志物。考虑到这个问题，质谱流程通常需要处理血浆样品，在分析前去除丰度最高的蛋白。复旦大学现代色谱分离分析实验室的研究人员设计出一种基于芯片的二维液相色谱系统，可在质谱分析之前去除血浆样品中的高丰度蛋白。这项成果发表在《Analytical Chemistry》上（复旦大学发表蛋白质组学新技术 ）。

来自瑞士和荷兰的科学家，对在22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质，进行了定量和定性分析。确定了超过2300个蛋白质，其中一些处于每个细胞一个副本的平均水平。由此产生的数据集描述了细胞中大多数（> 90%）的蛋白质量，对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。相关研究结果发表在2015年12月的《Nature Biotechnology》（科学家发表蛋白质组学重要成果 ）。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文索引：

Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome. Cell, 2016; DOI: 10.1016/j.cell.2016.06.041