智力残疾,可能与这10个基因有关

【字体: 时间:2016年08月04日 来源:生物通

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  荷兰内梅亨大学医学中心的一个研究小组对数千个de novo突变进行荟萃分析,鉴定出10个智力残疾的候选基因,这些突变是从两千多个患病家庭的外显子组序列中鉴定出的。这项研究成果于8月1日发表在《Nature Neuroscience》上。

  

生物通报道 荷兰内梅亨大学医学中心的一个研究小组对数千个de novo突变进行荟萃分析,鉴定出10个智力残疾的候选基因,这些突变是从两千多个患病家庭的外显子组序列中鉴定出的。这项研究成果于8月1日发表在《Nature Neuroscience》上。

在这项研究中,研究人员对820名患有轻度至重度智力残疾的儿童及其父母进行外显子组测序,随后综合了已发表研究中其他1,300个家庭的序列信息。当他们分析这些家庭中的2,637个de novo突变时,他们发现10个基因与智力残疾相关。

研究小组以820名患病儿童及其父母为研究对象,利用安捷伦的SureSelect技术富集了基因组的蛋白编码区域,并利用Illumina的HiSeq仪器进行测序。

在平均覆盖深度达75倍的外显子组中,研究人员发现了1,083个可疑的de novo突变,影响到915个基因。考虑到基因特异的突变率,他们发现18个已知的智力残疾基因,似乎不成比例地受到de novo突变的影响。

为了梳理出新的候选基因,研究小组剔除了已知基因中含有突变的个体,并重复分析,将频繁发生的de novo突变缩小到4个基因上:DLG4、PPM1D、SOX5和TCF20。此外,研究人员利用已发表研究中的数据,发现了另外6个候选基因。

在荟萃分析中,研究人员对1,471名个体中的1,235个基因进行分析,发现除了上面的4个基因之外,还有6个基因:RAC1、SMAD6、SON、TLK2、TRIP12和SYNCRIP,它们也包含许多功能丧失的de novo突变。

研究小组指出,一些基因中的de novo突变似乎产生了重叠的临床特征,包括两名儿童中TLK2基因的突变带来了相似的面部畸形。新分析中受到de novo突变影响的许多基因或通路与其他疾病的关联基因重叠,包括自闭症谱系障碍或其他神经发育疾病。

“我们的研究强调了de novo突变对各种神经发育表型的影响,”内梅亨大学医学中心的人类遗传学研究人员Christian Gilissen及其同事写道,并指出“大量的罕见发育障碍基因仍有待确定”。(生物通 薄荷)

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原文检索

Meta-analysis of 2,104 trios provides support for 10 new genes for intellectual disability

Nature Neuroscience (2016) doi:10.1038/nn.4352

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