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QIAGEN推出‘数字NGS’新产品[新品推荐]

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2016年8月5日 来源:生物通

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  QIAGEN公司近日宣布推出一套新颖的新一代测序集合产品。这些QIAseq NGS panel是基于专有的数字NGS技术,对DNA、RNA和miRNA实现无偏向的准确定量。

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生物通报道 QIAGEN公司近日宣布推出一套新颖的新一代测序集合产品。这些QIAseq NGS panel是基于专有的数字NGS技术,对DNA、RNA和miRNA实现无偏向的准确定量。

何谓数字NGS技术?它利用一种独特的分子索引技术(Molecular Index Technology),在所有测序平台上实现更准确的变异定量和检测。这种技术既适用于QIAGEN的GeneReader NGS系统,也同样适用于Illumina的MiSeq、NextSeq和HiSeq系统,以及赛默飞世尔的Ion PGM和Ion S5系统。

随着转化和临床研究逐渐投入NGS的怀抱,问题也应运而生。有时候,样品很有限,或核酸被降解。由于PCR扩增偏向的存在,在定量稀有转录本时,这些问题可能导致实验失败。数字NGS利用独特分子索引(UMI)来标记样品中的每个分子,以避免PCR诱导的扩增偏向和文库构建偏向。

与先进的引物设计和专利的检测技术相结合,QIAseq Targeted panel实现了稀有(低频)突变的可靠检测,以及富含GC区域的高效测序。此外,这种方法可准确鉴定其他方法往往无法检测的遗传变异。这些功能满足了之前无法满足的客户需求。

QIAGEN此次推出了四种新一代测序集合,包括:

• QIAseq Targeted DNA Panel – 结合UMI和独特技术来可靠检测低频的基因变异,并访问富有挑战性的基因组区域,包括富含GC的区域。
• QIAseq Targeted RNAscan Panel – 将UMI融入RNA文库的测序中,实现已知和新颖基因融合的更灵敏检测。
• QIAseq miRNA NGS Kit – 解决流程中的主要问题,带来高质量的数字NGS和无偏向的定量
• QIAseq Targeted RNAseq Kit – 利用UMI来准确定量最多1000个目标的基因表达

也许有人关心这个系统的灵敏度如何。若是新鲜样品,可使用1 ng至25 ng RNA来构建文库,若是FFPE样品(假设90%的样品严重降解或交联),可使用100 ng至250 ng来构建文库。当然,如果你的目标比较罕见,QIAGEN建议使用最大量。

除了预先设计的DNA和RNA panel,QIAGEN还宣布推出panel定制设计服务,让客户能扩展分析内容。这种服务是基于QIAGEN多年提供预验证内容的经验,目前已覆盖6万多个基因目标。

“即使是最困难的组织以及液体活检样品,QIAseq targeted panel也能带来可靠的NGS结果,让研究人员能够探索最深层的遗传变异,产生宝贵的分子见解。利用这种新颖的方法,QIAGEN正推出一整套NGS产品组合,”QIAGEN生命科学部门的副总裁Brad Crutchfield谈道。(生物通 余亮)

我想深入了解QIAGEN的数字NGS技术及相关产品

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