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单细胞分离的神器——ICELL8™ Single Cell System

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2017年12月13日 来源:Takara

摘要:

  ICELL8™ Single-Cell System,通过MultiSample NanoDispenser(MSND)能够准确的对4平方厘米的ICELL8芯片上搭载的5184个微孔进行50nL的分注。同时结合专用软件CellSelect自动选择单细胞,实现高通量且迅速的单细胞分选工作。

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单细胞分析是指在单个细胞水平上确定基因组序列或进行RNA分析,而不是细胞群体的平均分析,通过对每个细胞的变化进行动态追踪,能够对其进行系统理解。

ICELL8™ Single-Cell System,通过MultiSample NanoDispenser(MSND)能够准确的对4平方厘米的ICELL8芯片上搭载的5184个微孔进行50nL的分注。同时结合专用软件CellSelect自动选择单细胞,实现高通量且迅速的单细胞分选工作。

ICELL8™ Single Cell System特点

▪ 一次最多可以分离1800个单细胞
▪ 适用于5-100μm范围的细胞,且可以分析不同大小的细胞集团
▪ 只选择单细胞,排除了Doublet及空白孔来源的扩增
▪ 一枚ICELL8芯片上一次最多可以分析8种细胞样品,避免技术错误
▪ 从MSND分注细胞到“活的单细胞”判定耗时仅30分钟,减轻对细胞的负担
▪ 由于能选择想要分析的细胞、降低了NGS分析的时间及经济成本

SmartChip技术

通过在搭载有5184个微孔的ICELL8芯片上对多个样品进行准确的50nL分注,实现了高通量且再现性很高的分析。细胞的分注遵循泊松分布,理论上最多可以获得1800个单细胞。另外,一次可分注8种样品,分注在15分钟左右即可完成,将对细胞生存率的影响抑制到最小。

自动成像技术

使用Multi Sample Nano Dispenser(MSND)分注细胞后,成像阶段可以得到各个微孔的图像,使用专用的CellSelect软件能够对得到的图像数据中各微孔内的细胞数进行检出,自动判断细胞的生死。

由于只有被选择的细胞才可以进入后续的处理,从而可以节约反应试剂,缩短数据分析时间,节省NGS分析成本。

分子Barcode技术

ICELL8芯片上各孔预先固相化了识别用的Barcode,Barcode序列能够与CellSelect软件上的细胞图像连接。

由于每个Barcode序列添加了100万数量级种类的Unique Molecule Identifier(UMI),因而应用于NGS时能够只对样品独特的分子进行校正并定量。

不同大小的细胞集团同时分析

经过ICELL8进行的分注操作不受细胞大小的影响,能够对5-100μm的细胞均一分注,下图为使用ICELL8系统分注混合细胞样品的基因表达结果,显示了各个细胞特有的表达图像。

 

(http://www.ebiotrade.com/)

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