Oxford Nanopore推出新款纳米孔测序仪,并公开售价[新品推荐]

【字体: 时间:2017年03月17日 来源:生物通

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  英国生物技术公司Oxford Nanopore本周宣布,它的纳米孔测序产品家族添加了一个新成员:GridION X5。这个新的系统内最多能够带动五个MinION流动槽,并在单台设备中完成数据处理。

生物通报道  英国生物技术公司Oxford Nanopore本周宣布,它的纳米孔测序产品家族添加了一个新成员:GridION X5。这个新的系统内最多能够带动五个MinION流动槽,并在单台设备中完成数据处理。

Oxford Nanopore最知名的产品莫过于精妙小巧的MinION测序仪。这个只有U盘大小的仪器在2016年被生物通的读者评为“生命科学十大创新产品”之一,也成为科学家现场测序的首选。去年,它登上国际空间站,完成了第一次太空测序,也协助地球上的科学家监控寨卡病毒等疫情。

尽管MinION的每个流动槽能产生高达20 Gb,但仍然无法满足高通量实验室的需求。因此,Oxford Nanopore此次推出了GridION X5,可取代多台MinION的同时运行。据其首席技术官Clive Brown介绍,GridION能够在48小时内生成100 Gb的数据,并具有全面的数据处理能力。

GridION X5系统的测序部分包含五个流动槽。这些流动槽可单独使用或协同使用,并通过USB连接到计算机。与所有的纳米孔测序一样,它没有固定的运行时间。计算机则最多能控制五个流动槽,以1000 b/s的速度进行碱基检出。它包含新一代的CPU,8 TB的固态硬盘,FPGA处理器,以及Linux操作系统。

GridION X5系统现已公开发售,最迟在5月份发货。这个台式测序仪有两种价格模式:单独购买系统和流动槽,系统售价为12.5万美元,流动槽为299美元;或最初不花钱,但承诺购买300个流动槽,每个价格为475美元,外加1.5万美元的售后支持费。

在过去的一年中,MinION流动槽一直在改进,包括R9.4纳米孔和新的MinKNOW 1.4软件。Oxford Nanopore通过内部实验报告,单个流动槽的产量达到20 Gb,而客户也报告了10 Gb。利用这些数据,它计算出每Gb的成本约在14.95-47美元之间,具体取决于产量和购买形式。

Brown还宣布了一个认证计划,研究小组在通过认证后可利用GridION X5来提供测序服务。MinION是一台个人型测序仪,未获得服务产品的授权。不过,GridION X5可以提供大规模的纳米孔测序。不过他未介绍认证费用等细节,只表示服务供应商将接受专门的培训和验证,确保他们能熟练地操作这项技术。

GridION X5目前填补了MinION和PromethION之间的空白。MinION自首次推出以来,产量已提高40倍,开始对普通计算机带来挑战。PromethION仍是一种高通量测序仪,适用于大型项目或处理大量样品的客户。公司计划发布PromethION流动槽,其产量达MinION流动槽的6倍,因此整台PromethION能产生Tb级的数据。(生物通 余亮)

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