Nature子刊:癌症患病风险与lncRNA密切相关

【字体: 时间:2017年04月20日 来源:生物通

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  lncRNA是一类转录本长度大于200nt的非编码RNA产物,虽然不编码表达蛋白,但能够在转录、转录后和染色体修饰等多个层面,调控胚胎发育、细胞增殖、转移和分化等各种生命活动,其异常表达于多种肿瘤的发生发展密切相关。

  

生物通报道:lncRNA是一类转录本长度大于200nt的非编码RNA产物,虽然不编码表达蛋白,但能够在转录、转录后和染色体修饰等多个层面,调控胚胎发育、细胞增殖、转移和分化等各种生命活动,其异常表达于多种肿瘤的发生发展密切相关。

来自多伦多大学,玛格丽特公主癌症中心等处的研究人员发表了题为“Modulation of long noncoding RNAs by risk SNPs underlying genetic predispositions to prostate cancer”的文章,发现了这些长链非编码RNA(lncRNAs)的基因在激活疾病进程中所起的作用。

这一研究成果公布在Nature Genetics杂志上,文章的通讯作者是多伦多大学医学生物物理学系助理教授Hansen He,他表示,“我们的研究检测了与前列腺癌相关的遗传变异,发现一半的变异有可能是通过非编码基因而非蛋白质编码基因发挥功能。换句话说,我们发现非编码RNA在驱动前列腺癌形成和疾病发展中起着非常重要的作用。”

在前列腺癌中有100多个已知风险区域与这一疾病的发生发展有关联,但对于其中的大多数我们都不清楚它们是如何与前列腺癌相关联的。在这项研究工作中,研究人员发现其中一半的风险区域有可能是通过非编码基因来发挥作用。

整合这一关于遗传变异和非编码RNA功能的新知识,将促使科学界更加接近于开发出一种临床生物标记物,通过预测哪些人将会形成前列腺癌以及它们是否具有侵袭性,来推动患者个体化癌症治疗。

人们已知长链非编码RNA PCAT1在前列腺癌患者体内高水平表达,研究小组与玛格丽特公主基因组中心合作,进一步探究了与PCAT1有关的遗传变异,他们将焦点放在了这些非编码基因发挥作用的机制上。

“非编码RNA具有许多的功能,在这项研究中我们发现PCAT1发挥一种胶水作用,将不同的蛋白质复合物吸引到一起,引导它们去到特异的基因组位点,激活了它们的靶基因表达,开启了疾病过程,”He说:“随着我们针对与遗传变异相关的其他44个基因展开研究,我们将扩大这一知识。”

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癌症非常的聪明,会采取一切可能的方法来生存及利用我们基因组的每一部分。如果只将研究焦点放在构成2%基因组的蛋白质编码基因上,我们将非常有限地认识癌症的存活机制。不了解我们基因组其他98%的部分我们无法获得个体化癌症治疗。

由于它们在蛋白质编码基因之外,功能未知,这98%的区域过去被称作是“垃圾DNA”,这项研究通过研究遗传变异准确地找到了45个与前列腺癌疾病发生发展有关的基因,这为将来相关研究提供了重要信息。

原文标题:

Modulation of long noncoding RNAs by risk SNPs underlying genetic predispositions to prostate cancer

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