上海师范大学发表Nature子刊,解读菠菜遗传基因

【字体: 时间:2017年05月26日 来源:生物通

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  今天上海师范大学和Boyce Thompson研究所(BTI)在Nature Communications杂志上发表了一个新的菠菜基因组草图,帮助我们更好的了解菠菜。此外,作者们还测序了120种野生和家养菠菜的转录组,发现了有关菠菜驯化的遗传变化图谱。

  

大力水手Popeye说:“我吃菠菜,我很强壮”。

生物通报道:菠菜,原产于亚洲中部,现已在世界各地广泛种植。自从被首次驯养以后,园丁和育种员们已经对它的许多农艺性状进行了优化改进,如叶片的质量和营养等。随着时间的推移,这些改进工作重塑了菠菜最原始的基因组。反过来,当代的育种员们也可以再利用基因组信息加快菠菜的改进工作,特别是重大疾病的防治,如霜霉病等。

不管你爱不爱吃,菠菜的营养价值就在那里。有两队科学团队正在致力于改善菠菜营养和口感的研究。作为共同第一作者单位,今天上海师范大学和Boyce Thompson研究所(BTI)在Nature Communications杂志上发表了一个新的菠菜基因组草图,帮助我们更好的了解菠菜。此外,作者们还测序了120种野生和家养菠菜的转录组,发现了有关菠菜驯化的遗传变化图谱。索取上海生物芯片国家工程研究中心的转录组测序与分析服务的详细技术资料请填写联系方式

本文共同通讯作者康奈尔大学Boyce Thompson植物研究所费章君教授说:“菠菜基因组序列和转录变异体研究具有丰富价值,利用这些信息可以培育抗病性强、高产、质量更好的菠菜品种。”

费章君教授

本文主要通讯作者上海师范大学的王全华教授十分惊奇的发现,如今农业栽培的的菠菜品种与野生品种的基因组的差异并不明显。在经历几百年的植物驯化过程中,人们经常会遇到所谓的遗传变化瓶颈,通过瓶颈就能造就可以栽培耕作的植物,从此这些植物便与它们的野生亲戚们脱离了关系。最著名的例子就是玉米,野生玉米则称为蜀黍。

王全华教授

通过大规模分析所收集的120种人工品种和野生品种菠菜的转录组差异,本文发现与番茄和黄瓜等其他蔬菜作物相比,菠菜的驯化瓶颈相对较为弱化。这个发现对广大农民来说绝对是一个好消息,因为这意味着菠菜还有着很大的改良空间。与此同时,对菠菜育种学家来说可能是一个坏消息,因为这代表着通过精确的基因组标记加快菠菜育种的挑战难度也更大。尽管如此,这只研究小组还是鉴定了一些有价值的信息,例如与抽苔、叶片数量、和茎长相关的基因的驯化之路。

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本文第一作者Chen Jiao称她最喜欢的菠菜食谱是凉拌菠菜:“非常容易料理,我把菠菜、面包、炒腊肉、煮鸡蛋放倒一个碗里,然后洒上调料即可,美味又营养。”

看完文章,我们不禁要感谢Popeye的宣传,还要感谢这些背后的科学家们,是他们让我们拥有这些有助于身体强壮的美味佳肴。

原文标题:Draft genome of spinach and transcriptome diversity of 120 Spinaciaaccessions

王全华博士,教授,植物学专业硕士生导师。现任上海师范大学蔬菜花卉所所长。主要研究方向:蔬菜遗传育种;基因工程;蔬菜种质资源创新及评价。

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