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《Science》人类癌症转录组病理学地图
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年08月22日 来源:生物通
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8月17日瑞典的研究人员在《Science》报道了一个新的映射遗传变化的“开放存取目录”。这张“人类癌症转录组病理学地图(以下简称癌症地图)”致力于将成千上万的癌症特定基因与患者生存联系起来,并为潜在药物新靶点开发指路。
了解肿瘤遗传变化,将最致命的癌症与两性肿瘤区分开来,将有助于医生更好地治疗病人。
8月17日瑞典的研究人员在《Science》报道了一个新的映射遗传变化的“开放存取目录”。这张“人类癌症转录组病理学地图(以下简称癌症地图)”致力于将成千上万的癌症特定基因与患者生存联系起来,并为潜在药物新靶点开发指路。
项目带头人、瑞典皇家理工学院微生物学教授Mathias Uhlén使用超级计算机,分析了来自约8000个肿瘤标本的17种主要人类癌症。Uhlén表示,他的研究团队正在寻找这些突变给整个基因组带来的功能整体性变化。
然后,他们找出了癌细胞中所有基因所对应的蛋白质,以及这些蛋白质对患者生存率的影响。
研究人员观察到不同癌症中的蛋白质水平差异很大。据科研人员称,需要加强个性化癌症治疗以针对不同患者肿瘤特性。超过2000个基因对病人的生存都存在不同程度的影响。(具体详见原文)
另外,还鉴定出2000多个可能会扼杀肿瘤生长的基因,但是如果针对这些靶点使用药物将有可能产生严重副作用。
此前,研究人员一直致力于利用DNA测序来识别与癌症有关的基因突变,在描绘这张全新的癌症地图时,科学家们利用了RNA测序来了解受癌症影响时基因的变化情况。
基因测序公司Illumina的肿瘤学副总裁John Leite说,为了解驱动癌症生成的底层机制,我们需要大量的生物信息。这张新癌症地图就富含这些信息。
作为目前正在进行的最有价值的“地图”绘制研究之一,癌症地图的数据来自国立癌症研究所的癌症基因组地图等公共数据库,目标是收集可用于癌症诊断和药物开发的疾病标记。
原文标题:A pathology atlas of the human cancer transcriptome
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